RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465125.1

RERE-208, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 5

Gene RERE, Length 396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-208ENST00000465125 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.9■■■■□ 3.66
RERE-208ENST00000465125 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.9■■■■□ 3.66
RERE-208ENST00000465125 FANCAO15360 1455 aa37.89■■■■□ 3.66
RERE-208ENST00000465125 NEO1Q92859 1461 aa37.84■■■■□ 3.65
RERE-208ENST00000465125 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.83■■■■□ 3.65
RERE-208ENST00000465125 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.83■■■■□ 3.65
RERE-208ENST00000465125 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.82■■■■□ 3.65
RERE-208ENST00000465125 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
RERE-208ENST00000465125 AKNAQ7Z591 1439 aa37.77■■■■□ 3.64
RERE-208ENST00000465125 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
RERE-208ENST00000465125 MIA2Q96PC5 1412 aa37.72■■■■□ 3.63
RERE-208ENST00000465125 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.72■■■■□ 3.63
RERE-208ENST00000465125 ADGRL1O94910 1474 aa37.71■■■■□ 3.63
RERE-208ENST00000465125 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.69■■■■□ 3.62
RERE-208ENST00000465125 ABCC1P33527 1531 aa37.67■■■■□ 3.62
RERE-208ENST00000465125 KDM6BO15054 1643 aa37.65■■■■□ 3.62
RERE-208ENST00000465125 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.65■■■■□ 3.62
RERE-208ENST00000465125 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.65■■■■□ 3.62
RERE-208ENST00000465125 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.62■■■■□ 3.61
RERE-208ENST00000465125 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.62■■■■□ 3.61
RERE-208ENST00000465125 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.61■■■■□ 3.61
RERE-208ENST00000465125 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
RERE-208ENST00000465125 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
RERE-208ENST00000465125 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.58■■■■□ 3.61
RERE-208ENST00000465125 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
RERE-208ENST00000465125 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.56■■■■□ 3.6
RERE-208ENST00000465125 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
RERE-208ENST00000465125 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.53■■■■□ 3.6
RERE-208ENST00000465125 RICTORQ6R327 1708 aa37.51■■■■□ 3.6
RERE-208ENST00000465125 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.5■■■■□ 3.598e-7■■■■□ 20.1
RERE-208ENST00000465125 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.5■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.49■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 RAPGEF3O95398 923 aa37.48■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 MBD5Q9P267 1494 aa37.47■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.47■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.46■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
RERE-208ENST00000465125 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.43■■■■□ 3.58
RERE-208ENST00000465125 KDM5CP41229 1560 aa37.42■■■■□ 3.58
RERE-208ENST00000465125 AFAP1Q8N556 730 aa37.4■■■■□ 3.58
RERE-208ENST00000465125 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.4■■■■□ 3.58
RERE-208ENST00000465125 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.38■■■■□ 3.57
RERE-208ENST00000465125 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
RERE-208ENST00000465125 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
RERE-208ENST00000465125 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.34■■■■□ 3.57
RERE-208ENST00000465125 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.31■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 DAPK1P53355 1430 aa37.31■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 ABCC5O15440 1437 aa37.29■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.29■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.28■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.27■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.26■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 TSPY4P0CV99 314 aa37.26■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 TSPY10P0CW01 314 aa37.26■■■■□ 3.56
RERE-208ENST00000465125 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.26■■■■□ 3.55
RERE-208ENST00000465125 ATP7AQ04656 1500 aa37.26■■■■□ 3.55
RERE-208ENST00000465125 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.24■■■■□ 3.55
RERE-208ENST00000465125 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.23■■■■□ 3.55
RERE-208ENST00000465125 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.23■■■■□ 3.55
RERE-208ENST00000465125 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.22■■■■□ 3.55
RERE-208ENST00000465125 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.21■■■■□ 3.55
RERE-208ENST00000465125 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.19■■■■□ 3.54
RERE-208ENST00000465125 ITGAEP38570 1179 aa37.17■■■■□ 3.54
RERE-208ENST00000465125 ABCA6Q8N139 1617 aa37.17■■■■□ 3.54
RERE-208ENST00000465125 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.15■■■■□ 3.54
RERE-208ENST00000465125 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.12■■■■□ 3.53
RERE-208ENST00000465125 PTPRKQ15262 1439 aa37.11■■■■□ 3.53
RERE-208ENST00000465125 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.11■■■■□ 3.53
RERE-208ENST00000465125 PLXNC1O60486 1568 aa37.11■■■■□ 3.53
RERE-208ENST00000465125 ATP10AO60312 1499 aa37.07■■■■□ 3.53
RERE-208ENST00000465125 ADGRL2O95490 1459 aa37.07■■■■□ 3.53
RERE-208ENST00000465125 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.06■■■■□ 3.52
RERE-208ENST00000465125 REREQ9P2R6 1566 aa37.01■■■■□ 3.52
RERE-208ENST00000465125 ROCK1Q13464 1354 aa37■■■■□ 3.51
RERE-208ENST00000465125 KIF15Q9NS87 1388 aa37■■■■□ 3.51
RERE-208ENST00000465125 NCOA1Q15788 1441 aa37■■■■□ 3.51
RERE-208ENST00000465125 A2MP01023 1474 aa37■■■■□ 3.51
RERE-208ENST00000465125 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.97■■■■□ 3.51
RERE-208ENST00000465125 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.95■■■■□ 3.51
RERE-208ENST00000465125 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
RERE-208ENST00000465125 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.9■■■■□ 3.5
RERE-208ENST00000465125 AGLP35573 1532 aa36.88■■■■□ 3.49
RERE-208ENST00000465125 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
RERE-208ENST00000465125 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
RERE-208ENST00000465125 ERBINQ96RT1 1412 aa36.85■■■■□ 3.49
RERE-208ENST00000465125 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
RERE-208ENST00000465125 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.82■■■■□ 3.48
RERE-208ENST00000465125 HFM1A2PYH4 1435 aa36.8■■■■□ 3.48
RERE-208ENST00000465125 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.8■■■■□ 3.48
RERE-208ENST00000465125 NAIPQ13075 1403 aa36.78■■■■□ 3.48
RERE-208ENST00000465125 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.78■■■■□ 3.48
RERE-208ENST00000465125 KIF3BO15066 747 aa36.75■■■■□ 3.47
RERE-208ENST00000465125 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
RERE-208ENST00000465125 MLECQ14165 292 aa36.69■■■■□ 3.46
RERE-208ENST00000465125 GGT6Q6P531 493 aa36.65■■■■□ 3.46
RERE-208ENST00000465125 DEPDC5O75140 1603 aa36.63■■■■□ 3.45
RERE-208ENST00000465125 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.63■■■■□ 3.45
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