RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 DOK7Q18PE1 504 aa6.77□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 RIMBP2O15034 1052 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM205CA6NFA0 338 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 MFRPQ9BY79 579 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.72□□□□□ -1.33
ANKRD28-205ENST00000460278 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 ERBB3P21860 1342 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 POTEB3A0JP26 581 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 POTEBQ6S5H4 581 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.65□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.65□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 TMC2Q8TDI7 906 aa6.65□□□□□ -1.34
ANKRD28-205ENST00000460278 C2orf72A6NCS6 295 aa6.64□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.64□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 ARSIQ5FYB1 569 aa6.63□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R37O75864 691 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 MMRN1Q13201 1228 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR153Q6NV75 609 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 KIF3CO14782 793 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-205ENST00000460278 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.368e-11■■■■■ 33.8
ANKRD28-205ENST00000460278 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 ARXQ96QS3 562 aa6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 NUDT7P0C024 238 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.56□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC34A2O95436 690 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.54□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-205ENST00000460278 FOXK1P85037 733 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 PLPP6Q8IY26 295 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 CFAP44Q96MT7 982 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 LHX6Q9UPM6 363 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 TBC1D12O60347 775 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 DSG2Q14126 1118 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 NBR1Q14596 966 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 PBX2P40425 430 aa6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 PTGER2P43116 358 aa6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-205ENST00000460278 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 PDE4AP27815 886 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGAP33O14559 1287 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 OXER1Q8TDS5 423 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNH8Q96L42 1107 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 HOMEZQ8IX15 550 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-205ENST00000460278 PSEN2P49810 448 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 MAP3K9P80192 1104 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 STAC3Q96MF2 364 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNK17Q96T54 332 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 TK2O00142 265 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 EVI5O60447 810 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 MFSD10Q14728 455 aa6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-205ENST00000460278 PTPREP23469 700 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 FOSBP53539 338 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 JPH4Q96JJ6 628 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-205ENST00000460278 HCSTQ9UBK5 93 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms