RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458295.5

SH3BGR-209, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SH3BGR, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGR-209ENST00000458295 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BGR-209ENST00000458295 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGR-209ENST00000458295 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGR-209ENST00000458295 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGR-209ENST00000458295 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BGR-209ENST00000458295 KDM5CP41229 1560 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 PREX2Q70Z35 1606 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 CLIP1P30622 1438 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BGR-209ENST00000458295 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 ATP10AO60312 1499 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 ABCC1P33527 1531 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BGR-209ENST00000458295 REREQ9P2R6 1566 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BGR-209ENST00000458295 ABCA6Q8N139 1617 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BGR-209ENST00000458295 AFAP1Q8N556 730 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BGR-209ENST00000458295 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BGR-209ENST00000458295 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BGR-209ENST00000458295 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BGR-209ENST00000458295 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BGR-209ENST00000458295 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BGR-209ENST00000458295 MLECQ14165 292 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BGR-209ENST00000458295 AGLP35573 1532 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BGR-209ENST00000458295 SYCP2Q9BX26 1530 aa22■■□□□ 1.11
SH3BGR-209ENST00000458295 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGR-209ENST00000458295 HSPA2P54652 639 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BGR-209ENST00000458295 CEP162Q5TB80 1403 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 TIAM1Q13009 1591 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 C3P01024 1663 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 PLXNC1O60486 1568 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 ATP7AQ04656 1500 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGR-209ENST00000458295 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 STRCQ7RTU9 1775 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 MBD5Q9P267 1494 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 FBXO41Q8TF61 875 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 MROH2AA6NES4 1674 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BGR-209ENST00000458295 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BGR-209ENST00000458295 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGR-209ENST00000458295 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGR-209ENST00000458295 A2MP01023 1474 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGR-209ENST00000458295 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGR-209ENST00000458295 NCOA2Q15596 1464 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGR-209ENST00000458295 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BGR-209ENST00000458295 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGR-209ENST00000458295 NPATQ14207 1427 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGR-209ENST00000458295 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BGR-209ENST00000458295 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BGR-209ENST00000458295 ZMYM3Q14202 1370 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGR-209ENST00000458295 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 NCOA1Q15788 1441 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 PTPRTO14522 1441 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 PTPRKQ15262 1439 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 CERKQ8TCT0 537 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 MAP3K1Q13233 1512 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BGR-209ENST00000458295 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 GGT6Q6P531 493 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BGR-209ENST00000458295 PLA2R1Q13018 1463 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BGR-209ENST00000458295 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BGR-209ENST00000458295 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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