RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLCH2O75038 1416 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITGAEP38570 1179 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GLI2P10070 1586 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DAPK1P53355 1430 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CD109Q6YHK3 1445 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DIP2BQ9P265 1576 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC5O15440 1437 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTPRKQ15262 1439 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FANCAO15360 1455 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC1P33527 1531 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MBD5Q9P267 1494 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.75■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.75■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AKNAQ7Z591 1439 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ROCK1Q13464 1354 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HFM1A2PYH4 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TSPY4P0CV99 314 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TSPY10P0CW01 314 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NEO1Q92859 1461 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGRL1O94910 1474 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGRL2O95490 1459 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TSPOAP1O95153 1857 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NAIPQ13075 1403 aa22.66■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.66■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.66■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HRCP23327 699 aa22.66■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.65■■□□□ 1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCOA1Q15788 1441 aa22.64■■□□□ 1.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.64■■□□□ 1.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.63■■□□□ 1.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLXNC1O60486 1568 aa22.59■■□□□ 1.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.58■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AFAP1Q8N556 730 aa22.56■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.55■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDM6BO15054 1643 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF15Q9NS87 1388 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDM5CP41229 1560 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP7AQ04656 1500 aa22.52■■□□□ 1.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RICTORQ6R327 1708 aa22.51■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.48■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAPGEF3O95398 923 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERBINQ96RT1 1412 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM52Q96A61 297 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.39■■□□□ 1.18
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA6Q8N139 1617 aa22.37■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UNC13BO14795 1591 aa22.35■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A2MP01023 1474 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUP155O75694 1391 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.3 ms