RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, human

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ODC1-204	ENST00000446285	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.14	■■■■■ 4.5
ODC1-204	ENST00000446285	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.1	■■■■■ 4.49
ODC1-204	ENST00000446285	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43.1	■■■■■ 4.49
ODC1-204	ENST00000446285	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ODC1-204	ENST00000446285	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ODC1-204	ENST00000446285	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
ODC1-204	ENST00000446285	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.01	■■■■■ 4.48
ODC1-204	ENST00000446285	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.01	■■■■■ 4.48
ODC1-204	ENST00000446285	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ODC1-204	ENST00000446285	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ODC1-204	ENST00000446285	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.95	■■■■■ 4.47
ODC1-204	ENST00000446285	PTPRM	P28827	1452 aa		42.92	■■■■■ 4.46
ODC1-204	ENST00000446285	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ODC1-204	ENST00000446285	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ODC1-204	ENST00000446285	KDM5C	P41229	1560 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ODC1-204	ENST00000446285	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.89	■■■■■ 4.46
ODC1-204	ENST00000446285	ATP10A	O60312	1499 aa		42.85	■■■■■ 4.45
ODC1-204	ENST00000446285	ABCC1	P33527	1531 aa		42.85	■■■■■ 4.45
ODC1-204	ENST00000446285	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.82	■■■■■ 4.45
ODC1-204	ENST00000446285	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.8	■■■■■ 4.44
ODC1-204	ENST00000446285	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ODC1-204	ENST00000446285	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.78	■■■■■ 4.44
ODC1-204	ENST00000446285	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.78	■■■■■ 4.44
ODC1-204	ENST00000446285	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
ODC1-204	ENST00000446285	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
ODC1-204	ENST00000446285	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.74	■■■■■ 4.43
ODC1-204	ENST00000446285	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ODC1-204	ENST00000446285	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ODC1-204	ENST00000446285	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.69	■■■■■ 4.42
ODC1-204	ENST00000446285	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ODC1-204	ENST00000446285	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ODC1-204	ENST00000446285	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ODC1-204	ENST00000446285	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.66	■■■■■ 4.42
ODC1-204	ENST00000446285	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ODC1-204	ENST00000446285	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ODC1-204	ENST00000446285	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	MLEC	Q14165	292 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.59	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.58	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.57	■■■■■ 4.41
ODC1-204	ENST00000446285	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.55	■■■■■ 4.4
ODC1-204	ENST00000446285	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ODC1-204	ENST00000446285	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.52	■■■■■ 4.4
ODC1-204	ENST00000446285	AGL	P35573	1532 aa		42.51	■■■■■ 4.4
ODC1-204	ENST00000446285	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
ODC1-204	ENST00000446285	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.44	■■■■■ 4.38
ODC1-204	ENST00000446285	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.44	■■■■■ 4.38
ODC1-204	ENST00000446285	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
ODC1-204	ENST00000446285	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ODC1-204	ENST00000446285	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ODC1-204	ENST00000446285	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.37	■■■■■ 4.37
ODC1-204	ENST00000446285	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ODC1-204	ENST00000446285	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.32	■■■■■ 4.37
ODC1-204	ENST00000446285	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ODC1-204	ENST00000446285	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ODC1-204	ENST00000446285	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
ODC1-204	ENST00000446285	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
ODC1-204	ENST00000446285	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ODC1-204	ENST00000446285	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ODC1-204	ENST00000446285	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ODC1-204	ENST00000446285	A2M	P01023	1474 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ODC1-204	ENST00000446285	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ODC1-204	ENST00000446285	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
ODC1-204	ENST00000446285	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ODC1-204	ENST00000446285	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.19	■■■■■ 4.34
ODC1-204	ENST00000446285	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
ODC1-204	ENST00000446285	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ODC1-204	ENST00000446285	C3	P01024	1663 aa		42.17	■■■■■ 4.34
ODC1-204	ENST00000446285	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.16	■■■■■ 4.34
ODC1-204	ENST00000446285	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ODC1-204	ENST00000446285	HSPA2	P54652	639 aa		42.11	■■■■■ 4.33
ODC1-204	ENST00000446285	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.09	■■■■■ 4.33
ODC1-204	ENST00000446285	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.08	■■■■■ 4.33
ODC1-204	ENST00000446285	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
ODC1-204	ENST00000446285	APLP2	Q06481	763 aa		42.01	■■■■■ 4.32
ODC1-204	ENST00000446285	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.01	■■■■■ 4.32
ODC1-204	ENST00000446285	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.98	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	NPAT	Q14207	1427 aa		41.96	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ODC1-204	ENST00000446285	GGT6	Q6P531	493 aa		41.93	■■■■■ 4.3
ODC1-204	ENST00000446285	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.88	■■■■■ 4.29
ODC1-204	ENST00000446285	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.85	■■■■■ 4.29
ODC1-204	ENST00000446285	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		41.8	■■■■■ 4.28
ODC1-204	ENST00000446285	STRC	Q7RTU9	1775 aa		41.79	■■■■■ 4.28
ODC1-204	ENST00000446285	KIF3B	O15066	747 aa		41.79	■■■■■ 4.28
ODC1-204	ENST00000446285	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.77	■■■■■ 4.28
ODC1-204	ENST00000446285	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.73	■■■■■ 4.27
ODC1-204	ENST00000446285	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.71	■■■■■ 4.27
ODC1-204	ENST00000446285	FBXO41	Q8TF61	875 aa		41.7	■■■■■ 4.27
ODC1-204	ENST00000446285	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.69	■■■■■ 4.27
ODC1-204	ENST00000446285	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.69	■■■■■ 4.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms