RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444220.2

AP000347.1-208, humanhuman

TSL 4

Gene AP000347.1, Length 618 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000347.1-208ENST00000444220 PREX2Q70Z35 1606 aa36.81■■■■□ 3.48
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AP000347.1-208ENST00000444220 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.79■■■■□ 3.48
AP000347.1-208ENST00000444220 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.79■■■■□ 3.48
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AP000347.1-208ENST00000444220 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.77■■■■□ 3.48
AP000347.1-208ENST00000444220 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.75■■■■□ 3.47
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AP000347.1-208ENST00000444220 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.74■■■■□ 3.47
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AP000347.1-208ENST00000444220 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.64■■■■□ 3.46
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AP000347.1-208ENST00000444220 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.64■■■■□ 3.46
AP000347.1-208ENST00000444220 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.63■■■■□ 3.45
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AP000347.1-208ENST00000444220 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.54■■■■□ 3.44
AP000347.1-208ENST00000444220 AFAP1Q8N556 730 aa36.54■■■■□ 3.44
AP000347.1-208ENST00000444220 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
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AP000347.1-208ENST00000444220 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.52■■■■□ 3.44
AP000347.1-208ENST00000444220 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.51■■■■□ 3.44
AP000347.1-208ENST00000444220 ATP10AO60312 1499 aa36.51■■■■□ 3.44
AP000347.1-208ENST00000444220 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.49■■■■□ 3.43
AP000347.1-208ENST00000444220 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.49■■■■□ 3.43
AP000347.1-208ENST00000444220 ABCA6Q8N139 1617 aa36.48■■■■□ 3.43
AP000347.1-208ENST00000444220 TIAM1Q13009 1591 aa36.44■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.44■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.44■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.44■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.43■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.42■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.41■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 REREQ9P2R6 1566 aa36.39■■■■□ 3.42
AP000347.1-208ENST00000444220 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
AP000347.1-208ENST00000444220 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
AP000347.1-208ENST00000444220 MLECQ14165 292 aa36.33■■■■□ 3.41
AP000347.1-208ENST00000444220 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.33■■■■□ 3.41
AP000347.1-208ENST00000444220 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.31■■■■□ 3.4
AP000347.1-208ENST00000444220 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.31■■■■□ 3.4
AP000347.1-208ENST00000444220 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.4
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AP000347.1-208ENST00000444220 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
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AP000347.1-208ENST00000444220 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.21■■■■□ 3.39
AP000347.1-208ENST00000444220 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
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AP000347.1-208ENST00000444220 MBD5Q9P267 1494 aa36.17■■■■□ 3.38
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AP000347.1-208ENST00000444220 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
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AP000347.1-208ENST00000444220 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.03■■■■□ 3.36
AP000347.1-208ENST00000444220 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36■■■■□ 3.35
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AP000347.1-208ENST00000444220 HSPA2P54652 639 aa35.92■■■■□ 3.34
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AP000347.1-208ENST00000444220 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.91■■■■□ 3.34
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AP000347.1-208ENST00000444220 APLP2Q06481 763 aa35.8■■■■□ 3.32
AP000347.1-208ENST00000444220 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.79■■■■□ 3.32
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AP000347.1-208ENST00000444220 ZMYM3Q14202 1370 aa35.76■■■■□ 3.31
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AP000347.1-208ENST00000444220 STRCQ7RTU9 1775 aa35.73■■■■□ 3.31
AP000347.1-208ENST00000444220 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.72■■■■□ 3.31
AP000347.1-208ENST00000444220 TSPY4P0CV99 314 aa35.72■■■■□ 3.31
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AP000347.1-208ENST00000444220 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.67■■■■□ 3.3
AP000347.1-208ENST00000444220 KIF3BO15066 747 aa35.66■■■■□ 3.3
AP000347.1-208ENST00000444220 PTPRKQ15262 1439 aa35.64■■■■□ 3.3
AP000347.1-208ENST00000444220 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.64■■■■□ 3.3
AP000347.1-208ENST00000444220 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.63■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.62■■■■□ 3.29
AP000347.1-208ENST00000444220 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
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