RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441102.6

ZHX3-208, Transcript of zinc fingers and homeoboxes 3, human

TSL 2

Gene ZHX3, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZHX3-208	ENST00000441102	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.95	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.92	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ZHX3-208	ENST00000441102	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
ZHX3-208	ENST00000441102	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ZHX3-208	ENST00000441102	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ZHX3-208	ENST00000441102	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.86	■■■■□ 3.01
ZHX3-208	ENST00000441102	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.83	■■■■□ 3.01
ZHX3-208	ENST00000441102	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.8	■■■■□ 3
ZHX3-208	ENST00000441102	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.8	■■■■□ 3
ZHX3-208	ENST00000441102	PTPRM	P28827	1452 aa		33.79	■■■■□ 3
ZHX3-208	ENST00000441102	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.78	■■■■□ 3
ZHX3-208	ENST00000441102	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.77	■■■■□ 3
ZHX3-208	ENST00000441102	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.77	■■■■□ 3
ZHX3-208	ENST00000441102	KDM5C	P41229	1560 aa		33.77	■■■■□ 3
ZHX3-208	ENST00000441102	ABCC1	P33527	1531 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ZHX3-208	ENST00000441102	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ZHX3-208	ENST00000441102	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
ZHX3-208	ENST00000441102	ATP10A	O60312	1499 aa		33.71	■■■□□ 2.99
ZHX3-208	ENST00000441102	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.71	■■■□□ 2.99
ZHX3-208	ENST00000441102	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.7	■■■□□ 2.98
ZHX3-208	ENST00000441102	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
ZHX3-208	ENST00000441102	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.68	■■■□□ 2.98
ZHX3-208	ENST00000441102	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.67	■■■□□ 2.98
ZHX3-208	ENST00000441102	MLEC	Q14165	292 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ZHX3-208	ENST00000441102	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
ZHX3-208	ENST00000441102	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ZHX3-208	ENST00000441102	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ZHX3-208	ENST00000441102	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ZHX3-208	ENST00000441102	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ZHX3-208	ENST00000441102	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.6	■■■□□ 2.97
ZHX3-208	ENST00000441102	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.6	■■■□□ 2.97
ZHX3-208	ENST00000441102	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.59	■■■□□ 2.97
ZHX3-208	ENST00000441102	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ZHX3-208	ENST00000441102	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
ZHX3-208	ENST00000441102	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ZHX3-208	ENST00000441102	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.55	■■■□□ 2.96
ZHX3-208	ENST00000441102	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ZHX3-208	ENST00000441102	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.54	■■■□□ 2.96
ZHX3-208	ENST00000441102	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.51	■■■□□ 2.96
ZHX3-208	ENST00000441102	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.51	■■■□□ 2.95
ZHX3-208	ENST00000441102	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
ZHX3-208	ENST00000441102	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ZHX3-208	ENST00000441102	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.45	■■■□□ 2.95
ZHX3-208	ENST00000441102	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ZHX3-208	ENST00000441102	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ZHX3-208	ENST00000441102	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
ZHX3-208	ENST00000441102	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
ZHX3-208	ENST00000441102	AGL	P35573	1532 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ZHX3-208	ENST00000441102	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
ZHX3-208	ENST00000441102	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ZHX3-208	ENST00000441102	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ZHX3-208	ENST00000441102	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ZHX3-208	ENST00000441102	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
ZHX3-208	ENST00000441102	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
ZHX3-208	ENST00000441102	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ZHX3-208	ENST00000441102	HSPA2	P54652	639 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ZHX3-208	ENST00000441102	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ZHX3-208	ENST00000441102	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.26	■■■□□ 2.92
ZHX3-208	ENST00000441102	A2M	P01023	1474 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ZHX3-208	ENST00000441102	C3	P01024	1663 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ZHX3-208	ENST00000441102	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ZHX3-208	ENST00000441102	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ZHX3-208	ENST00000441102	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ZHX3-208	ENST00000441102	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ZHX3-208	ENST00000441102	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ZHX3-208	ENST00000441102	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ZHX3-208	ENST00000441102	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ZHX3-208	ENST00000441102	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ZHX3-208	ENST00000441102	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ZHX3-208	ENST00000441102	GGT6	Q6P531	493 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ZHX3-208	ENST00000441102	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.07	■■■□□ 2.89
ZHX3-208	ENST00000441102	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.89
ZHX3-208	ENST00000441102	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
ZHX3-208	ENST00000441102	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
ZHX3-208	ENST00000441102	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
ZHX3-208	ENST00000441102	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ZHX3-208	ENST00000441102	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ZHX3-208	ENST00000441102	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ZHX3-208	ENST00000441102	APLP2	Q06481	763 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ZHX3-208	ENST00000441102	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ZHX3-208	ENST00000441102	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ZHX3-208	ENST00000441102	KIF3B	O15066	747 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ZHX3-208	ENST00000441102	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ZHX3-208	ENST00000441102	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ZHX3-208	ENST00000441102	NPAT	Q14207	1427 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ZHX3-208	ENST00000441102	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ZHX3-208	ENST00000441102	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ZHX3-208	ENST00000441102	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.9	■■■□□ 2.86
ZHX3-208	ENST00000441102	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ZHX3-208	ENST00000441102	ABCC5	O15440	1437 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ZHX3-208	ENST00000441102	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.82	■■■□□ 2.85
ZHX3-208	ENST00000441102	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ZHX3-208	ENST00000441102	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ZHX3-208	ENST00000441102	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84

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