RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 MADDQ8WXG6 1647 aa41.11■■■■■ 4.17
ANKRD28-203ENST00000439830 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.1■■■■■ 4.17
ANKRD28-203ENST00000439830 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.1■■■■■ 4.17
ANKRD28-203ENST00000439830 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.09■■■■■ 4.17
ANKRD28-203ENST00000439830 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
ANKRD28-203ENST00000439830 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.08■■■■■ 4.17
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.07■■■■■ 4.16
ANKRD28-203ENST00000439830 PTPRMP28827 1452 aa41.06■■■■■ 4.16
ANKRD28-203ENST00000439830 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.05■■■■■ 4.16
ANKRD28-203ENST00000439830 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.04■■■■■ 4.16
ANKRD28-203ENST00000439830 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.02■■■■■ 4.16
ANKRD28-203ENST00000439830 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.01■■■■■ 4.16
ANKRD28-203ENST00000439830 PREX2Q70Z35 1606 aa41.01■■■■■ 4.16
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ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.93■■■■■ 4.14
ANKRD28-203ENST00000439830 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.93■■■■■ 4.14
ANKRD28-203ENST00000439830 KDM5CP41229 1560 aa40.9■■■■■ 4.14
ANKRD28-203ENST00000439830 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.86■■■■■ 4.13
ANKRD28-203ENST00000439830 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.84■■■■■ 4.13
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP10AO60312 1499 aa40.83■■■■■ 4.13
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCC1P33527 1531 aa40.83■■■■■ 4.13
ANKRD28-203ENST00000439830 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.83■■■■■ 4.13
ANKRD28-203ENST00000439830 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.74■■■■■ 4.11
ANKRD28-203ENST00000439830 AFAP1Q8N556 730 aa40.73■■■■■ 4.11
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCA6Q8N139 1617 aa40.71■■■■■ 4.11
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.7■■■■■ 4.11
ANKRD28-203ENST00000439830 MLECQ14165 292 aa40.69■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.68■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 REREQ9P2R6 1566 aa40.68■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP162Q5TB80 1403 aa40.67■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.66■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.65■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.65■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.65■■■■■ 4.1
ANKRD28-203ENST00000439830 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.57■■■■■ 4.09
ANKRD28-203ENST00000439830 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.57■■■■■ 4.08
ANKRD28-203ENST00000439830 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.56■■■■■ 4.08
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
ANKRD28-203ENST00000439830 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.51■■■■■ 4.08
ANKRD28-203ENST00000439830 AGLP35573 1532 aa40.5■■■■■ 4.07
ANKRD28-203ENST00000439830 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.48■■■■■ 4.07
ANKRD28-203ENST00000439830 TIAM1Q13009 1591 aa40.48■■■■■ 4.07
ANKRD28-203ENST00000439830 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.46■■■■■ 4.07
ANKRD28-203ENST00000439830 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
ANKRD28-203ENST00000439830 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.43■■■■■ 4.06
ANKRD28-203ENST00000439830 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
ANKRD28-203ENST00000439830 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP7AQ04656 1500 aa40.39■■■■■ 4.06
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ANKRD28-203ENST00000439830 C3P01024 1663 aa40.37■■■■■ 4.05
ANKRD28-203ENST00000439830 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
ANKRD28-203ENST00000439830 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.057e-7■■■■□ 22.6
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ANKRD28-203ENST00000439830 HSPA2P54652 639 aa40.33■■■■■ 4.05
ANKRD28-203ENST00000439830 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
ANKRD28-203ENST00000439830 PLXNC1O60486 1568 aa40.27■■■■■ 4.04
ANKRD28-203ENST00000439830 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.26■■■■■ 4.04
ANKRD28-203ENST00000439830 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.25■■■■■ 4.03
ANKRD28-203ENST00000439830 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
ANKRD28-203ENST00000439830 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.24■■■■■ 4.03
ANKRD28-203ENST00000439830 NCOA2Q15596 1464 aa40.24■■■■■ 4.03
ANKRD28-203ENST00000439830 MROH2AA6NES4 1674 aa40.23■■■■■ 4.03
ANKRD28-203ENST00000439830 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.23■■■■■ 4.03
ANKRD28-203ENST00000439830 A2MP01023 1474 aa40.19■■■■■ 4.03
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
ANKRD28-203ENST00000439830 MBD5Q9P267 1494 aa40.19■■■■■ 4.02
ANKRD28-203ENST00000439830 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.18■■■■■ 4.02
ANKRD28-203ENST00000439830 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.13■■■■■ 4.01
ANKRD28-203ENST00000439830 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.1■■■■■ 4.01
ANKRD28-203ENST00000439830 STRCQ7RTU9 1775 aa40.08■■■■■ 4.01
ANKRD28-203ENST00000439830 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.08■■■■■ 4.01
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.07■■■■■ 4.01
ANKRD28-203ENST00000439830 MAP3K1Q13233 1512 aa40.05■■■■■ 4
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.01■■■■□ 3.99
ANKRD28-203ENST00000439830 FBXO41Q8TF61 875 aa40■■■■□ 3.99
ANKRD28-203ENST00000439830 NPATQ14207 1427 aa39.99■■■■□ 3.99
ANKRD28-203ENST00000439830 ZMYM3Q14202 1370 aa39.97■■■■□ 3.99
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ANKRD28-203ENST00000439830 GGT6Q6P531 493 aa39.93■■■■□ 3.98
ANKRD28-203ENST00000439830 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
ANKRD28-203ENST00000439830 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.89■■■■□ 3.98
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.87■■■■□ 3.97
ANKRD28-203ENST00000439830 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.87■■■■□ 3.97
ANKRD28-203ENST00000439830 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PTPRKQ15262 1439 aa39.82■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.82■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.81■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.81■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 NCOA1Q15788 1441 aa39.79■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 MIA2Q96PC5 1412 aa39.79■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.79■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 TSPY4P0CV99 314 aa39.78■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 TSPY10P0CW01 314 aa39.78■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.76■■■■□ 3.96
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