RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.21□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMK2BQ13554 666 aa8.19□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 APBB1O00213 710 aa8.18□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 FLIIQ13045 1269 aa8.18□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.18□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.17□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
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CBX1P4-201ENST00000439415 CABP2Q9NPB3 220 aa8.17□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID3CA6NKF2 412 aa8.15□□□□□ -1.1
CBX1P4-201ENST00000439415 GABBR2O75899 941 aa8.14□□□□□ -1.11
CBX1P4-201ENST00000439415 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.14□□□□□ -1.11
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM117AQ9C073 453 aa8.14□□□□□ -1.11
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.14□□□□□ -1.11
CBX1P4-201ENST00000439415 CHADLQ6NUI6 762 aa8.13□□□□□ -1.11
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CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.09□□□□□ -1.11
CBX1P4-201ENST00000439415 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 A6NJR5 290 aa8.08□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.08□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 GOPCQ9HD26 462 aa8.06□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR37O15354 613 aa8.05□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAK2O60296 914 aa8.05□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.05□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP2K5Q13163 448 aa8.04□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 AMHR2Q16671 573 aa8.04□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.04□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 LHX8Q68G74 356 aa8.04□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 DPYSL4O14531 572 aa8.03□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K13O43283 966 aa8.03□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 PDIA6Q15084 440 aa8.03□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 NECTIN2Q92692 538 aa8.03□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC102AQ96A19 550 aa8.03□□□□□ -1.12
CBX1P4-201ENST00000439415 CLCN6P51797 869 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.02□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 IRF6O14896 467 aa8.01□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.01□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 CD44P16070 742 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF12Q96FN5 646 aa8□□□□□ -1.13
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CBX1P4-201ENST00000439415 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.98□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEIP0CG38 1075 aa7.97□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.97□□□□□ -1.13
CBX1P4-201ENST00000439415 NUTM2FA1L443 756 aa7.96□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 GNPATO15228 680 aa7.96□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.96□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 MCM6Q14566 821 aa7.94□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 HIC1Q14526 733 aa7.93□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.93□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.92□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 FCHSD2O94868 740 aa7.92□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 DSG2Q14126 1118 aa7.91□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CBX1P4-201ENST00000439415 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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CBX1P4-201ENST00000439415 MS4A1P11836 297 aa7.89□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.89□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPP22059 807 aa7.88□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 FECHP22830 423 aa7.88□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXK1P85037 733 aa7.88□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.88□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.88□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K9P80192 1104 aa7.86□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 TMC2Q8TDI7 906 aa7.86□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.86□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.85□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 POM121Q96HA1 1249 aa7.84□□□□□ -1.15
CBX1P4-201ENST00000439415 PLPP6Q8IY26 295 aa7.83□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 OXER1Q8TDS5 423 aa7.83□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 PTGER2P43116 358 aa7.82□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.82□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 RGS22Q8NE09 1264 aa7.82□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 PTGDRQ13258 359 aa7.81□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 RETREG2Q8NC44 543 aa7.81□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.81□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 CLCN1P35523 988 aa7.8□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.8□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.79□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 MICALL2Q8IY33 904 aa7.78□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX12PQ92771 950 aa7.78□□□□□ -1.16
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