RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439048.1

MMS19-210, Transcript of MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, humanhuman

TSL 5

Gene MMS19, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19-210ENST00000439048 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.18■■■□□ 2.26
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MMS19-210ENST00000439048 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.15■■■□□ 2.26
MMS19-210ENST00000439048 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.15■■■□□ 2.26
MMS19-210ENST00000439048 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.15■■■□□ 2.26
MMS19-210ENST00000439048 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.14■■■□□ 2.26
MMS19-210ENST00000439048 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.14■■■□□ 2.26
MMS19-210ENST00000439048 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.13■■■□□ 2.25
MMS19-210ENST00000439048 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.13■■■□□ 2.25
MMS19-210ENST00000439048 TIAM1Q13009 1591 aa29.09■■■□□ 2.25
MMS19-210ENST00000439048 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.06■■■□□ 2.24
MMS19-210ENST00000439048 ABCC1P33527 1531 aa29.05■■■□□ 2.24
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MMS19-210ENST00000439048 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.04■■■□□ 2.24
MMS19-210ENST00000439048 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.04■■■□□ 2.24
MMS19-210ENST00000439048 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.04■■■□□ 2.24
MMS19-210ENST00000439048 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.01■■■□□ 2.23
MMS19-210ENST00000439048 KDM5CP41229 1560 aa28.99■■■□□ 2.23
MMS19-210ENST00000439048 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
MMS19-210ENST00000439048 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.98■■■□□ 2.23
MMS19-210ENST00000439048 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.98■■■□□ 2.23
MMS19-210ENST00000439048 MAP3K1Q13233 1512 aa28.95■■■□□ 2.23
MMS19-210ENST00000439048 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.95■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.94■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 NCOA2Q15596 1464 aa28.93■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.93■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.93■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.92■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.91■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 AFAP1Q8N556 730 aa28.91■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.9■■■□□ 2.22
MMS19-210ENST00000439048 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.86■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.86■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 ATP10AO60312 1499 aa28.86■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.86■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.86■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.86■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.85■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.84■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 APLP2Q06481 763 aa28.83■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 ABCA6Q8N139 1617 aa28.83■■■□□ 2.21
MMS19-210ENST00000439048 MADDQ8WXG6 1647 aa28.8■■■□□ 2.2
MMS19-210ENST00000439048 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
MMS19-210ENST00000439048 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
MMS19-210ENST00000439048 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.78■■■□□ 2.2
MMS19-210ENST00000439048 REREQ9P2R6 1566 aa28.77■■■□□ 2.2
MMS19-210ENST00000439048 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
MMS19-210ENST00000439048 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.75■■■□□ 2.19
MMS19-210ENST00000439048 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
MMS19-210ENST00000439048 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
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MMS19-210ENST00000439048 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
MMS19-210ENST00000439048 MBD5Q9P267 1494 aa28.71■■■□□ 2.19
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MMS19-210ENST00000439048 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.69■■■□□ 2.18
MMS19-210ENST00000439048 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.68■■■□□ 2.18
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MMS19-210ENST00000439048 AGLP35573 1532 aa28.66■■■□□ 2.18
MMS19-210ENST00000439048 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.63■■■□□ 2.17
MMS19-210ENST00000439048 MIA2Q96PC5 1412 aa28.63■■■□□ 2.17
MMS19-210ENST00000439048 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.59■■■□□ 2.17
MMS19-210ENST00000439048 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.59■■■□□ 2.17
MMS19-210ENST00000439048 PLXNC1O60486 1568 aa28.58■■■□□ 2.17
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MMS19-210ENST00000439048 A2MP01023 1474 aa28.57■■■□□ 2.16
MMS19-210ENST00000439048 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.52■■■□□ 2.16
MMS19-210ENST00000439048 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.5■■■□□ 2.15
MMS19-210ENST00000439048 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.49■■■□□ 2.15
MMS19-210ENST00000439048 TSPY4P0CV99 314 aa28.48■■■□□ 2.15
MMS19-210ENST00000439048 TSPY10P0CW01 314 aa28.48■■■□□ 2.15
MMS19-210ENST00000439048 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.48■■■□□ 2.15
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MMS19-210ENST00000439048 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.43■■■□□ 2.14
MMS19-210ENST00000439048 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.43■■■□□ 2.14
MMS19-210ENST00000439048 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
MMS19-210ENST00000439048 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.4■■■□□ 2.14
MMS19-210ENST00000439048 C3P01024 1663 aa28.39■■■□□ 2.14
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MMS19-210ENST00000439048 MROH2AA6NES4 1674 aa28.38■■■□□ 2.13
MMS19-210ENST00000439048 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.37■■■□□ 2.13
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MMS19-210ENST00000439048 ABCC5O15440 1437 aa28.35■■■□□ 2.13
MMS19-210ENST00000439048 DAPK1P53355 1430 aa28.35■■■□□ 2.13
MMS19-210ENST00000439048 GGT6Q6P531 493 aa28.35■■■□□ 2.13
MMS19-210ENST00000439048 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
MMS19-210ENST00000439048 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.33■■■□□ 2.13
MMS19-210ENST00000439048 KIF3BO15066 747 aa28.3■■■□□ 2.12
MMS19-210ENST00000439048 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.29■■■□□ 2.12
MMS19-210ENST00000439048 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
MMS19-210ENST00000439048 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.28■■■□□ 2.12
MMS19-210ENST00000439048 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.28■■■□□ 2.12
MMS19-210ENST00000439048 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
MMS19-210ENST00000439048 ZMYM3Q14202 1370 aa28.25■■■□□ 2.11
MMS19-210ENST00000439048 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
MMS19-210ENST00000439048 KIF15Q9NS87 1388 aa28.25■■■□□ 2.11
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