RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

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Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.38■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.37■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.36■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.36■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.35■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.35■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.34■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.33■■■□□ 2.45
LIN28AP1-201ENST00000429574 PTPRMP28827 1452 aa30.29■■■□□ 2.44
LIN28AP1-201ENST00000429574 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.28■■■□□ 2.44
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.25■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 MADDQ8WXG6 1647 aa30.25■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 MLECQ14165 292 aa30.24■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.23■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 AFAP1Q8N556 730 aa30.22■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.21■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 ATP10AO60312 1499 aa30.2■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 PREX2Q70Z35 1606 aa30.2■■■□□ 2.43
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
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LIN28AP1-201ENST00000429574 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.17■■■□□ 2.42
LIN28AP1-201ENST00000429574 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.15■■■□□ 2.42
LIN28AP1-201ENST00000429574 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
LIN28AP1-201ENST00000429574 CEP162Q5TB80 1403 aa30.14■■■□□ 2.42
LIN28AP1-201ENST00000429574 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.14■■■□□ 2.42
LIN28AP1-201ENST00000429574 KDM5CP41229 1560 aa30.1■■■□□ 2.41
LIN28AP1-201ENST00000429574 ABCC1P33527 1531 aa30.09■■■□□ 2.41
LIN28AP1-201ENST00000429574 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.08■■■□□ 2.41
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.08■■■□□ 2.41
LIN28AP1-201ENST00000429574 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.08■■■□□ 2.41
LIN28AP1-201ENST00000429574 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.07■■■□□ 2.41
LIN28AP1-201ENST00000429574 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.05■■■□□ 2.4
LIN28AP1-201ENST00000429574 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.04■■■□□ 2.4
LIN28AP1-201ENST00000429574 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
LIN28AP1-201ENST00000429574 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.01■■■□□ 2.4
LIN28AP1-201ENST00000429574 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.99■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.98■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.97■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.96■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 ABCA6Q8N139 1617 aa29.96■■■□□ 2.39
LIN28AP1-201ENST00000429574 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.95■■■□□ 2.38
LIN28AP1-201ENST00000429574 REREQ9P2R6 1566 aa29.94■■■□□ 2.38
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.91■■■□□ 2.38
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.91■■■□□ 2.38
LIN28AP1-201ENST00000429574 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.91■■■□□ 2.38
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TIAM1Q13009 1591 aa29.85■■■□□ 2.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 A2MP01023 1474 aa29.74■■■□□ 2.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.73■■■□□ 2.35
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LIN28AP1-201ENST00000429574 C3P01024 1663 aa29.72■■■□□ 2.35
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LIN28AP1-201ENST00000429574 FBXO41Q8TF61 875 aa29.69■■■□□ 2.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.69■■■□□ 2.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.68■■■□□ 2.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 MBD5Q9P267 1494 aa29.67■■■□□ 2.34
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TSPY10P0CW01 314 aa29.66■■■□□ 2.34
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LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.64■■■□□ 2.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.63■■■□□ 2.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 PLXNC1O60486 1568 aa29.61■■■□□ 2.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 MROH2AA6NES4 1674 aa29.61■■■□□ 2.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZMYM3Q14202 1370 aa29.61■■■□□ 2.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.6■■■□□ 2.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIF3BO15066 747 aa29.55■■■□□ 2.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 NPATQ14207 1427 aa29.54■■■□□ 2.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.52■■■□□ 2.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.48■■■□□ 2.31
LIN28AP1-201ENST00000429574 MIA2Q96PC5 1412 aa29.47■■■□□ 2.31
LIN28AP1-201ENST00000429574 STRCQ7RTU9 1775 aa29.45■■■□□ 2.31
LIN28AP1-201ENST00000429574 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.44■■■□□ 2.3
LIN28AP1-201ENST00000429574 CERKQ8TCT0 537 aa29.43■■■□□ 2.3
LIN28AP1-201ENST00000429574 PTPRKQ15262 1439 aa29.39■■■□□ 2.3
LIN28AP1-201ENST00000429574 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.36■■■□□ 2.29
LIN28AP1-201ENST00000429574 PTPRTO14522 1441 aa29.36■■■□□ 2.29
LIN28AP1-201ENST00000429574 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.35■■■□□ 2.29
LIN28AP1-201ENST00000429574 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.35■■■□□ 2.29
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