RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427167.5

SEMA3C-204, Transcript of semaphorin 3C, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3C, Length 785 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3C-204ENST00000427167 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.55■■■■□ 3.44
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SEMA3C-204ENST00000427167 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
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SEMA3C-204ENST00000427167 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.41■■■■□ 3.42
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SEMA3C-204ENST00000427167 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.39■■■■□ 3.42
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SEMA3C-204ENST00000427167 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.21■■■■□ 3.39
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SEMA3C-204ENST00000427167 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.16■■■■□ 3.38
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SEMA3C-204ENST00000427167 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.13■■■■□ 3.37
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SEMA3C-204ENST00000427167 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.78■■■■□ 3.32
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SEMA3C-204ENST00000427167 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.73■■■■□ 3.31
SEMA3C-204ENST00000427167 C3P01024 1663 aa35.7■■■■□ 3.31
SEMA3C-204ENST00000427167 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.7■■■■□ 3.31
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SEMA3C-204ENST00000427167 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.68■■■■□ 3.3
SEMA3C-204ENST00000427167 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.67■■■■□ 3.3
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SEMA3C-204ENST00000427167 MIA2Q96PC5 1412 aa35.64■■■■□ 3.3
SEMA3C-204ENST00000427167 TSPY4P0CV99 314 aa35.62■■■■□ 3.29
SEMA3C-204ENST00000427167 TSPY10P0CW01 314 aa35.62■■■■□ 3.29
SEMA3C-204ENST00000427167 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
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SEMA3C-204ENST00000427167 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.57■■■■□ 3.29
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SEMA3C-204ENST00000427167 ZMYM3Q14202 1370 aa35.54■■■■□ 3.28
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SEMA3C-204ENST00000427167 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.49■■■■□ 3.27
SEMA3C-204ENST00000427167 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.49■■■■□ 3.27
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SEMA3C-204ENST00000427167 NPATQ14207 1427 aa35.43■■■■□ 3.26
SEMA3C-204ENST00000427167 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.37■■■■□ 3.25
SEMA3C-204ENST00000427167 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
SEMA3C-204ENST00000427167 ABCC5O15440 1437 aa35.37■■■■□ 3.25
SEMA3C-204ENST00000427167 PTPRKQ15262 1439 aa35.37■■■■□ 3.25
SEMA3C-204ENST00000427167 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
SEMA3C-204ENST00000427167 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.36■■■■□ 3.25
SEMA3C-204ENST00000427167 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.33■■■■□ 3.25
SEMA3C-204ENST00000427167 DAPK1P53355 1430 aa35.33■■■■□ 3.25
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