RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425265.6

RHOC-210, Transcript of ras homolog family member C, humanhuman

TSL 3

Gene RHOC, Length 866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOC-210ENST00000425265 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.23■■■□□ 2.59
RHOC-210ENST00000425265 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.21■■■□□ 2.59
RHOC-210ENST00000425265 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.19■■■□□ 2.58
RHOC-210ENST00000425265 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.18■■■□□ 2.58
RHOC-210ENST00000425265 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
RHOC-210ENST00000425265 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.15■■■□□ 2.58
RHOC-210ENST00000425265 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.13■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 PREX2Q70Z35 1606 aa31.12■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 CLIP1P30622 1438 aa31.11■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.1■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.1■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 KDM5CP41229 1560 aa31.09■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
RHOC-210ENST00000425265 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.07■■■□□ 2.56
RHOC-210ENST00000425265 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.06■■■□□ 2.56
RHOC-210ENST00000425265 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.02■■■□□ 2.56
RHOC-210ENST00000425265 ABCC1P33527 1531 aa31.02■■■□□ 2.56
RHOC-210ENST00000425265 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.01■■■□□ 2.56
RHOC-210ENST00000425265 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.01■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 ATP10AO60312 1499 aa30.99■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.99■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.98■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.98■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 ABCA6Q8N139 1617 aa30.96■■■□□ 2.55
RHOC-210ENST00000425265 AFAP1Q8N556 730 aa30.93■■■□□ 2.54
RHOC-210ENST00000425265 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.92■■■□□ 2.54
RHOC-210ENST00000425265 REREQ9P2R6 1566 aa30.91■■■□□ 2.54
RHOC-210ENST00000425265 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.89■■■□□ 2.54
RHOC-210ENST00000425265 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.89■■■□□ 2.53
RHOC-210ENST00000425265 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.88■■■□□ 2.53
RHOC-210ENST00000425265 MLECQ14165 292 aa30.86■■■□□ 2.53
RHOC-210ENST00000425265 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
RHOC-210ENST00000425265 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.8■■■□□ 2.52
RHOC-210ENST00000425265 CEP162Q5TB80 1403 aa30.79■■■□□ 2.52
RHOC-210ENST00000425265 AGLP35573 1532 aa30.77■■■□□ 2.52
RHOC-210ENST00000425265 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.74■■■□□ 2.51
RHOC-210ENST00000425265 TIAM1Q13009 1591 aa30.74■■■□□ 2.51
RHOC-210ENST00000425265 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.71■■■□□ 2.51
RHOC-210ENST00000425265 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.71■■■□□ 2.51
RHOC-210ENST00000425265 HSPA2P54652 639 aa30.7■■■□□ 2.51
RHOC-210ENST00000425265 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 C3P01024 1663 aa30.68■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.66■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.65■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 ATP7AQ04656 1500 aa30.64■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.64■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.64■■■□□ 2.5
RHOC-210ENST00000425265 PLXNC1O60486 1568 aa30.62■■■□□ 2.49
RHOC-210ENST00000425265 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
RHOC-210ENST00000425265 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.62■■■□□ 2.49
RHOC-210ENST00000425265 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.61■■■□□ 2.49
RHOC-210ENST00000425265 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
RHOC-210ENST00000425265 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
RHOC-210ENST00000425265 MBD5Q9P267 1494 aa30.56■■■□□ 2.48
RHOC-210ENST00000425265 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
RHOC-210ENST00000425265 STRCQ7RTU9 1775 aa30.55■■■□□ 2.48
RHOC-210ENST00000425265 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
RHOC-210ENST00000425265 FBXO41Q8TF61 875 aa30.54■■■□□ 2.48
RHOC-210ENST00000425265 MROH2AA6NES4 1674 aa30.53■■■□□ 2.48
RHOC-210ENST00000425265 NCOA2Q15596 1464 aa30.5■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.49■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 A2MP01023 1474 aa30.49■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.48■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.47■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.47■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.47■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
RHOC-210ENST00000425265 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.43■■■□□ 2.46
RHOC-210ENST00000425265 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.38■■■□□ 2.45
RHOC-210ENST00000425265 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.37■■■□□ 2.45
RHOC-210ENST00000425265 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.37■■■□□ 2.45
RHOC-210ENST00000425265 NPATQ14207 1427 aa30.34■■■□□ 2.45
RHOC-210ENST00000425265 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.33■■■□□ 2.45
RHOC-210ENST00000425265 ZMYM3Q14202 1370 aa30.33■■■□□ 2.45
RHOC-210ENST00000425265 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
RHOC-210ENST00000425265 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
RHOC-210ENST00000425265 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.31■■■□□ 2.44
RHOC-210ENST00000425265 MAP3K1Q13233 1512 aa30.31■■■□□ 2.44
RHOC-210ENST00000425265 PTPRKQ15262 1439 aa30.28■■■□□ 2.44
RHOC-210ENST00000425265 NCOA1Q15788 1441 aa30.27■■■□□ 2.44
RHOC-210ENST00000425265 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
RHOC-210ENST00000425265 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 CERKQ8TCT0 537 aa30.25■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.23■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 GGT6Q6P531 493 aa30.23■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 PTPRTO14522 1441 aa30.22■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.22■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.2■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
RHOC-210ENST00000425265 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.15■■■□□ 2.42
RHOC-210ENST00000425265 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.15■■■□□ 2.42
RHOC-210ENST00000425265 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.15■■■□□ 2.42
RHOC-210ENST00000425265 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.15■■■□□ 2.42
RHOC-210ENST00000425265 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.15■■■□□ 2.42
RHOC-210ENST00000425265 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms