RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.08□□□□□ -0.96
CCDC82-202ENST00000423339 PBX2P40425 430 aa9.07□□□□□ -0.96
CCDC82-202ENST00000423339 ARSIQ5FYB1 569 aa9.06□□□□□ -0.96
CCDC82-202ENST00000423339 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CCDC82-202ENST00000423339 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.02□□□□□ -0.96
CCDC82-202ENST00000423339 HCSTQ9UBK5 93 aa9.02□□□□□ -0.96
CCDC82-202ENST00000423339 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CCDC82-202ENST00000423339 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.98□□□□□ -0.97
CCDC82-202ENST00000423339 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CCDC82-202ENST00000423339 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.98□□□□□ -0.97
CCDC82-202ENST00000423339 NLRP6P59044 892 aa8.97□□□□□ -0.97
CCDC82-202ENST00000423339 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
CCDC82-202ENST00000423339 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.94□□□□□ -0.98
CCDC82-202ENST00000423339 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCDC82-202ENST00000423339 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCDC82-202ENST00000423339 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CCDC82-202ENST00000423339 NUDT7P0C024 238 aa8.9□□□□□ -0.98
CCDC82-202ENST00000423339 SLC34A2O95436 690 aa8.89□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 LHX6Q9UPM6 363 aa8.89□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 ARHGAP33O14559 1287 aa8.87□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.87□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.87□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 TK2O00142 265 aa8.86□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 KIF3CO14782 793 aa8.85□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.85□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 C2orf72A6NCS6 295 aa8.85□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.85□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 STAC3Q96MF2 364 aa8.85□□□□□ -0.99
CCDC82-202ENST00000423339 RGS20O76081 388 aa8.83□□□□□ -1
CCDC82-202ENST00000423339 TMC2Q8TDI7 906 aa8.83□□□□□ -1
CCDC82-202ENST00000423339 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.83□□□□□ -1
CCDC82-202ENST00000423339 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCDC82-202ENST00000423339 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CCDC82-202ENST00000423339 KCNH8Q96L42 1107 aa8.79□□□□□ -1
CCDC82-202ENST00000423339 STK24Q9Y6E0 443 aa8.79□□□□□ -1
CCDC82-202ENST00000423339 HRO43593 1189 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 MFRPQ9BY79 579 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 IFFO2Q5TF58 517 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 STK25O00506 426 aa8.71□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D12O60347 775 aa8.71□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.71□□□□□ -1.01
CCDC82-202ENST00000423339 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCDC82-202ENST00000423339 PSEN2P49810 448 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC82-202ENST00000423339 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC82-202ENST00000423339 PTPN5P54829 565 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC82-202ENST00000423339 KCNK17Q96T54 332 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 A0A0G2JS52 829 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 FOXK1P85037 733 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 PLPP6Q8IY26 295 aa8.6□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.59□□□□□ -1.03
CCDC82-202ENST00000423339 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 WNT2BQ93097 391 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 PTPREP23469 700 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF3Q9H094 633 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R37O75864 691 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC82-202ENST00000423339 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-202ENST00000423339 DSG2Q14126 1118 aa8.5□□□□□ -1.05
CCDC82-202ENST00000423339 Q6ZNB5 142 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-202ENST00000423339 OXER1Q8TDS5 423 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-202ENST00000423339 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC82-202ENST00000423339 LAPTM4AQ15012 233 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC82-202ENST00000423339 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 FOSBP53539 338 aa8.46□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 JPH4Q96JJ6 628 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 RGL2O15211 777 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.41□□□□□ -1.06
CCDC82-202ENST00000423339 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 KCNC4Q03721 635 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 EVI5O60447 810 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.35□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 PKD2Q13563 968 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.34□□□□□ -1.07
CCDC82-202ENST00000423339 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCDC82-202ENST00000423339 PDE4AP27815 886 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-202ENST00000423339 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.32□□□□□ -1.08
CCDC82-202ENST00000423339 BCAMP50895 628 aa8.31□□□□□ -1.08
CCDC82-202ENST00000423339 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCDC82-202ENST00000423339 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-202ENST00000423339 GFRA3O60609 400 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-202ENST00000423339 FBXW7Q969H0 707 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms