RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.34■□□□□ 0.21
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.1■□□□□ 0.17
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLXNC1O60486 1568 aa15.97■□□□□ 0.15
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A2MP01023 1474 aa15.92■□□□□ 0.14
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.89■□□□□ 0.13
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.87■□□□□ 0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCC5O15440 1437 aa15.86■□□□□ 0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C3P01024 1663 aa15.84■□□□□ 0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TSPY4P0CV99 314 aa15.84■□□□□ 0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TSPY10P0CW01 314 aa15.84■□□□□ 0.13
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