RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414380.1

SH2D3C-204, Transcript of SH2 domain containing 3C, human

TSL 3

Gene SH2D3C, Length 778 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH2D3C-204	ENST00000414380	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.41	■■■■■ 4.54
SH2D3C-204	ENST00000414380	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.39	■■■■■ 4.54
SH2D3C-204	ENST00000414380	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SH2D3C-204	ENST00000414380	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		43.35	■■■■■ 4.53
SH2D3C-204	ENST00000414380	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		43.34	■■■■■ 4.53
SH2D3C-204	ENST00000414380	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SH2D3C-204	ENST00000414380	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SH2D3C-204	ENST00000414380	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.31	■■■■■ 4.52
SH2D3C-204	ENST00000414380	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.29	■■■■■ 4.52
SH2D3C-204	ENST00000414380	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.23	■■■■■ 4.51
SH2D3C-204	ENST00000414380	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SH2D3C-204	ENST00000414380	ABCC1	P33527	1531 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SH2D3C-204	ENST00000414380	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.19	■■■■■ 4.5
SH2D3C-204	ENST00000414380	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.18	■■■■■ 4.5
SH2D3C-204	ENST00000414380	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SH2D3C-204	ENST00000414380	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SH2D3C-204	ENST00000414380	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SH2D3C-204	ENST00000414380	KDM5C	P41229	1560 aa		43.13	■■■■■ 4.5
SH2D3C-204	ENST00000414380	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SH2D3C-204	ENST00000414380	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SH2D3C-204	ENST00000414380	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
SH2D3C-204	ENST00000414380	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SH2D3C-204	ENST00000414380	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SH2D3C-204	ENST00000414380	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.07	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.04	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.04	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43.04	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
SH2D3C-204	ENST00000414380	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SH2D3C-204	ENST00000414380	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SH2D3C-204	ENST00000414380	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SH2D3C-204	ENST00000414380	ATP10A	O60312	1499 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SH2D3C-204	ENST00000414380	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SH2D3C-204	ENST00000414380	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SH2D3C-204	ENST00000414380	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SH2D3C-204	ENST00000414380	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SH2D3C-204	ENST00000414380	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SH2D3C-204	ENST00000414380	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SH2D3C-204	ENST00000414380	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SH2D3C-204	ENST00000414380	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SH2D3C-204	ENST00000414380	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SH2D3C-204	ENST00000414380	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.84	■■■■■ 4.45
SH2D3C-204	ENST00000414380	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.44
SH2D3C-204	ENST00000414380	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
SH2D3C-204	ENST00000414380	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SH2D3C-204	ENST00000414380	PTPRM	P28827	1452 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SH2D3C-204	ENST00000414380	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
SH2D3C-204	ENST00000414380	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SH2D3C-204	ENST00000414380	APLP2	Q06481	763 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SH2D3C-204	ENST00000414380	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
SH2D3C-204	ENST00000414380	MLEC	Q14165	292 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SH2D3C-204	ENST00000414380	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SH2D3C-204	ENST00000414380	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SH2D3C-204	ENST00000414380	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
SH2D3C-204	ENST00000414380	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.69	■■■■■ 4.42
SH2D3C-204	ENST00000414380	AGL	P35573	1532 aa		42.63	■■■■■ 4.42
SH2D3C-204	ENST00000414380	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.59	■■■■■ 4.41
SH2D3C-204	ENST00000414380	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.59	■■■■■ 4.41
SH2D3C-204	ENST00000414380	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SH2D3C-204	ENST00000414380	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.54	■■■■■ 4.4
SH2D3C-204	ENST00000414380	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SH2D3C-204	ENST00000414380	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SH2D3C-204	ENST00000414380	A2M	P01023	1474 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SH2D3C-204	ENST00000414380	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SH2D3C-204	ENST00000414380	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SH2D3C-204	ENST00000414380	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SH2D3C-204	ENST00000414380	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SH2D3C-204	ENST00000414380	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.33	■■■■■ 4.37
SH2D3C-204	ENST00000414380	C3	P01024	1663 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.29	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
SH2D3C-204	ENST00000414380	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.25	■■■■■ 4.35
SH2D3C-204	ENST00000414380	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
SH2D3C-204	ENST00000414380	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
SH2D3C-204	ENST00000414380	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SH2D3C-204	ENST00000414380	GGT6	Q6P531	493 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SH2D3C-204	ENST00000414380	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
SH2D3C-204	ENST00000414380	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SH2D3C-204	ENST00000414380	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
SH2D3C-204	ENST00000414380	ABCC5	O15440	1437 aa		42.13	■■■■■ 4.34
SH2D3C-204	ENST00000414380	DAPK1	P53355	1430 aa		42.12	■■■■■ 4.33
SH2D3C-204	ENST00000414380	KIF3B	O15066	747 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SH2D3C-204	ENST00000414380	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SH2D3C-204	ENST00000414380	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
SH2D3C-204	ENST00000414380	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SH2D3C-204	ENST00000414380	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.03	■■■■■ 4.32
SH2D3C-204	ENST00000414380	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.02	■■■■■ 4.32
SH2D3C-204	ENST00000414380	HSPA2	P54652	639 aa		42.02	■■■■■ 4.32
SH2D3C-204	ENST00000414380	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32

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