RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 P3H3Q8IVL6 736 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMC2Q8TDI7 906 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIF3CO14782 793 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 FOXK1P85037 733 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 C2orf72A6NCS6 295 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 E2F4Q16254 413 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-57P-201ENST00000411348 POTEB2H3BUK9 544 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 CAMK2BQ13554 666 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 DSG2Q14126 1118 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 POTEJP0CG39 1038 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLPP6Q8IY26 295 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 LHX8Q68G74 356 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 BCANQ96GW7 911 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC34A2O95436 690 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 NBR1Q14596 966 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLAIN1Q8ND83 568 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 SNPHO15079 494 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 RIMBP2O15034 1052 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 DOK7Q18PE1 504 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 OXER1Q8TDS5 423 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 TBC1D12O60347 775 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 PDIA6Q15084 440 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 OTUD5Q96G74 571 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAP3K9P80192 1104 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 DPYSL4O14531 572 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-57P-201ENST00000411348 EVI5O60447 810 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTGER2P43116 358 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPR153Q6NV75 609 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 SEMA3EO15041 775 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 EPAS1Q99814 870 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 PHF14O94880 888 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARSIQ5FYB1 569 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 JPH4Q96JJ6 628 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 NUDT7P0C024 238 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 FBXW7Q969H0 707 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-57P-201ENST00000411348 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 FOSBP53539 338 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 ST18O60284 1047 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 DDX12PQ92771 950 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 OSBPP22059 807 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 LHX6Q9UPM6 363 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 EMP3P54852 163 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 CERKQ8TCT0 537 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 BCL2L12Q9HB09 334 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 ERBB3P21860 1342 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAP3K7O43318 606 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 PBX2P40425 430 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCNH8Q96L42 1107 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-57P-201ENST00000411348 FCHSD2O94868 740 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 NUTM2FA1L443 756 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPR37O15354 613 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTPREP23469 700 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 HIC1Q14526 733 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-57P-201ENST00000411348 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms