RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SGIP1Q9BQI5 828 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MCM6Q14566 821 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DCAF8Q5TAQ9 597 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCDC125Q86Z20 511 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPDYE2BA6NHP3 402 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPDYE6P0CI01 402 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDE4CQ08493 712 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPDYE2Q495Y8 402 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KCNA1Q09470 495 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCDC27Q2M243 656 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POM121Q96HA1 1249 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SSUH2Q9Y2M2 353 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NUBP1P53384 320 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GOPCQ9HD26 462 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 UNCXA6NJT0 531 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CAPN15O75808 1086 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CANXP27824 592 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BRD1O95696 1058 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CERS3Q8IU89 383 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF592Q92610 1267 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PSMD1Q99460 953 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM212AQ96EL1 285 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AMHR2Q16671 573 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TICAM2Q86XR7 235 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPATA32Q96LK8 384 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 OSCARQ8IYS5 282 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCDC102AQ96A19 550 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 COG6Q9Y2V7 657 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ABCB7O75027 752 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KDM4AO75164 1064 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 USTQ9Y2C2 406 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.65□□□□□ -1.66
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GPR37O15354 613 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP1R37O75864 691 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CLSTN1O94985 981 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DRC1Q96MC2 740 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MFRPQ9BY79 579 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IRF6O14896 467 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NEFLP07196 543 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PYGBP11216 843 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAP2K5Q13163 448 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CARNS1A5YM72 827 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPDYE5A6NIY4 337 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ANKRD62A6NC57 917 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TBC1D12O60347 775 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MS4A1P11836 297 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MFSD10Q14728 455 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TCF3P15923 654 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDE4AP27815 886 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CAMK2BQ13554 666 aa4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms