RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409739.2

TRAF3IP1-203, Transcript of TRAF3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP1, Length 1,070 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ADGRL1O94910 1474 aa49.45■■■■■ 5.51
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP49.44■■■■■ 5.51
TRAF3IP1-203ENST00000409739 RAPGEF3O95398 923 aa49.43■■■■■ 5.5
TRAF3IP1-203ENST00000409739 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa49.42■■■■■ 5.5
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MAP3K1Q13233 1512 aa49.37■■■■■ 5.49
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP49.35■■■■■ 5.49
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP49.34■■■■■ 5.49
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SCAPERQ9BY12 1400 aa49.34■■■■■ 5.49
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa49.31■■■■■ 5.48
TRAF3IP1-203ENST00000409739 POGZQ7Z3K3 1410 aa49.3■■■■■ 5.48
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ITSN2Q9NZM3 1697 aa49.29■■■■■ 5.48
TRAF3IP1-203ENST00000409739 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa49.28■■■■■ 5.48
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ABCC1P33527 1531 aa49.28■■■■■ 5.48
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CCNB3Q8WWL7 1395 aa49.25■■■■■ 5.47
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa49.24■■■■■ 5.47
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa49.23■■■■■ 5.47
TRAF3IP1-203ENST00000409739 NCOA2Q15596 1464 aa49.21■■■■■ 5.47
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa49.15■■■■■ 5.46
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KDM5CP41229 1560 aa49.15■■■■■ 5.46
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa49.14■■■■■ 5.46
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa49.11■■■■■ 5.45
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MAGI2Q86UL8 1455 aa49.09■■■■■ 5.45
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP49.07■■■■■ 5.45
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SYCP2Q9BX26 1530 aa49.07■■■■■ 5.45
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
TRAF3IP1-203ENST00000409739 YEATS2Q9ULM3 1422 aa49.04■■■■■ 5.44
TRAF3IP1-203ENST00000409739 HECW2Q9P2P5 1572 aa49.03■■■■■ 5.44
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa49.03■■■■■ 5.44
TRAF3IP1-203ENST00000409739 APLP2Q06481 763 aa49.02■■■■■ 5.44
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa49.01■■■■■ 5.44
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.99■■■■■ 5.43
TRAF3IP1-203ENST00000409739 AFAP1Q8N556 730 aa48.98■■■■■ 5.43
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.95■■■■■ 5.43
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa48.94■■■■■ 5.42
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MLH3Q9UHC1 1453 aa48.89■■■■■ 5.42
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa48.88■■■■■ 5.42
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ABCA6Q8N139 1617 aa48.87■■■■■ 5.41
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa48.86■■■■■ 5.41
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
TRAF3IP1-203ENST00000409739 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.85■■■■■ 5.41
TRAF3IP1-203ENST00000409739 BCORL1Q5H9F3 1711 aa48.84■■■■■ 5.41
TRAF3IP1-203ENST00000409739 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.84■■■■■ 5.41
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ATP10AO60312 1499 aa48.81■■■■■ 5.4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MYOM3Q5VTT5 1437 aa48.79■■■■■ 5.4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 C9orf84Q5VXU9 1444 aa48.79■■■■■ 5.4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MBD5Q9P267 1494 aa48.79■■■■■ 5.4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ADAMTSL3P82987 1691 aa48.78■■■■■ 5.4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP48.77■■■■■ 5.4
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MYT1LQ9UL68 1186 aa48.73■■■■■ 5.39
TRAF3IP1-203ENST00000409739 REREQ9P2R6 1566 aa48.73■■■■■ 5.39
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ATP7AQ04656 1500 aa48.72■■■■■ 5.39
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP48.71■■■■■ 5.39
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MIA2Q96PC5 1412 aa48.69■■■■■ 5.39
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP48.66■■■■■ 5.38
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ARHGEF5Q12774 1597 aa48.66■■■■■ 5.38
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CCDC141Q6ZP82 1450 aa48.64■■■■■ 5.38
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MADDQ8WXG6 1647 aa48.64■■■■■ 5.38
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PTPN23Q9H3S7 1636 aa48.58■■■■■ 5.37
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ADGBQ8N7X0 1667 aa48.54■■■■■ 5.36
TRAF3IP1-203ENST00000409739 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa48.52■■■■■ 5.36
TRAF3IP1-203ENST00000409739 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
TRAF3IP1-203ENST00000409739 FGD6Q6ZV73 1430 aa48.51■■■■■ 5.36
TRAF3IP1-203ENST00000409739 AGLP35573 1532 aa48.51■■■■■ 5.36
TRAF3IP1-203ENST00000409739 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa48.49■■■■■ 5.35
TRAF3IP1-203ENST00000409739 RSPH4AQ5TD94 716 aa48.48■■■■■ 5.35
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PLXNC1O60486 1568 aa48.47■■■■■ 5.35
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.43■■■■■ 5.34
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.42■■■■■ 5.34
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MLECQ14165 292 aa48.41■■■■■ 5.34
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PTPRMP28827 1452 aa48.41■■■■■ 5.34
TRAF3IP1-203ENST00000409739 A2MP01023 1474 aa48.4■■■■■ 5.34
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TSPY4P0CV99 314 aa48.29■■■■■ 5.32
TRAF3IP1-203ENST00000409739 TSPY10P0CW01 314 aa48.29■■■■■ 5.32
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ABCC5O15440 1437 aa48.24■■■■■ 5.31
TRAF3IP1-203ENST00000409739 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.24■■■■■ 5.31
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DAPK1P53355 1430 aa48.22■■■■■ 5.31
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
TRAF3IP1-203ENST00000409739 C3P01024 1663 aa48.08■■■■■ 5.29
TRAF3IP1-203ENST00000409739 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
TRAF3IP1-203ENST00000409739 MROH2AA6NES4 1674 aa48.06■■■■■ 5.28
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
TRAF3IP1-203ENST00000409739 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CNTLNQ9NXG0 1405 aa48.01■■■■■ 5.28
TRAF3IP1-203ENST00000409739 DUOX2Q9NRD8 1548 aa48.01■■■■■ 5.28
TRAF3IP1-203ENST00000409739 PLPPR3Q6T4P5 718 aa47.98■■■■■ 5.27
TRAF3IP1-203ENST00000409739 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
TRAF3IP1-203ENST00000409739 GGT6Q6P531 493 aa47.96■■■■■ 5.27
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KIF15Q9NS87 1388 aa47.96■■■■■ 5.27
TRAF3IP1-203ENST00000409739 KIF3BO15066 747 aa47.95■■■■■ 5.27
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ADGRL2O95490 1459 aa47.92■■■■■ 5.26
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP47.89■■■■■ 5.26
TRAF3IP1-203ENST00000409739 CHIC2Q9UKJ5 165 aa47.89■■■■■ 5.26
TRAF3IP1-203ENST00000409739 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa47.88■■■■■ 5.25
TRAF3IP1-203ENST00000409739 FAM135AQ9P2D6 1515 aa47.87■■■■■ 5.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms