RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402876.3

PARVB-202, Transcript of parvin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PARVB, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVB-202ENST00000402876 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.38■■■□□ 2.29
PARVB-202ENST00000402876 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.38■■■□□ 2.29
PARVB-202ENST00000402876 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.37■■■□□ 2.29
PARVB-202ENST00000402876 PLCH2O75038 1416 aa29.35■■■□□ 2.29
PARVB-202ENST00000402876 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
PARVB-202ENST00000402876 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.31■■■□□ 2.28
PARVB-202ENST00000402876 ITGAEP38570 1179 aa29.31■■■□□ 2.28
PARVB-202ENST00000402876 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PARVB-202ENST00000402876 GLI2P10070 1586 aa29.29■■■□□ 2.28
PARVB-202ENST00000402876 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
PARVB-202ENST00000402876 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.27■■■□□ 2.28
PARVB-202ENST00000402876 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.26■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 DIP2BQ9P265 1576 aa29.26■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.25■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.24■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.24■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.23■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 DAPK1P53355 1430 aa29.23■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 CD109Q6YHK3 1445 aa29.21■■■□□ 2.27
PARVB-202ENST00000402876 FANCAO15360 1455 aa29.19■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.18■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 ABCC1P33527 1531 aa29.18■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.18■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 ABCC5O15440 1437 aa29.18■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 PTPRKQ15262 1439 aa29.18■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.17■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.15■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 MBD5Q9P267 1494 aa29.14■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.14■■■□□ 2.26
PARVB-202ENST00000402876 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.13■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.12■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.12■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 AKNAQ7Z591 1439 aa29.11■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 ROCK1Q13464 1354 aa29.09■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.08■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 HFM1A2PYH4 1435 aa29.08■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.08■■■□□ 2.25
PARVB-202ENST00000402876 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.06■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 ADGRL1O94910 1474 aa29.06■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 ADGRL2O95490 1459 aa29.06■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 NEO1Q92859 1461 aa29.06■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.05■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.05■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 TSPOAP1O95153 1857 aa29.04■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.03■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 TSPY4P0CV99 314 aa29.03■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 TSPY10P0CW01 314 aa29.03■■■□□ 2.24
PARVB-202ENST00000402876 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 NAIPQ13075 1403 aa29.01■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.99■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.99■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.99■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.97■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 NCOA1Q15788 1441 aa28.96■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.96■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 PLXNC1O60486 1568 aa28.96■■■□□ 2.23
PARVB-202ENST00000402876 HRCP23327 699 aa28.93■■■□□ 2.22
PARVB-202ENST00000402876 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.92■■■□□ 2.22
PARVB-202ENST00000402876 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PARVB-202ENST00000402876 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.89■■■□□ 2.22
PARVB-202ENST00000402876 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.88■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.88■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 KDM5CP41229 1560 aa28.87■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 RICTORQ6R327 1708 aa28.86■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 ATP7AQ04656 1500 aa28.86■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 KDM6BO15054 1643 aa28.85■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 KIF15Q9NS87 1388 aa28.85■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 AFAP1Q8N556 730 aa28.84■■■□□ 2.21
PARVB-202ENST00000402876 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PARVB-202ENST00000402876 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.82■■■□□ 2.2
PARVB-202ENST00000402876 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.8■■■□□ 2.2
PARVB-202ENST00000402876 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.8■■■□□ 2.2
PARVB-202ENST00000402876 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.79■■■□□ 2.2
PARVB-202ENST00000402876 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.76■■■□□ 2.19
PARVB-202ENST00000402876 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.76■■■□□ 2.19
PARVB-202ENST00000402876 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PARVB-202ENST00000402876 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.73■■■□□ 2.19
PARVB-202ENST00000402876 ERBINQ96RT1 1412 aa28.72■■■□□ 2.19
PARVB-202ENST00000402876 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.72■■■□□ 2.19
PARVB-202ENST00000402876 RAPGEF3O95398 923 aa28.68■■■□□ 2.18
PARVB-202ENST00000402876 ABCA6Q8N139 1617 aa28.67■■■□□ 2.18
PARVB-202ENST00000402876 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PARVB-202ENST00000402876 TRIM52Q96A61 297 aa28.66■■■□□ 2.18
PARVB-202ENST00000402876 UNC13BO14795 1591 aa28.65■■■□□ 2.18
PARVB-202ENST00000402876 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.64■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.63■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.62■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.62■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 A2MP01023 1474 aa28.59■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PARVB-202ENST00000402876 DEPDC5O75140 1603 aa28.56■■■□□ 2.16
PARVB-202ENST00000402876 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PARVB-202ENST00000402876 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.4 ms