RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399312.2

MRPS6-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPS6, Length 990 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS6-201ENST00000399312 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPS6-201ENST00000399312 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPS6-201ENST00000399312 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPS6-201ENST00000399312 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.27■■□□□ 1.64
MRPS6-201ENST00000399312 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.27■■□□□ 1.64
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.27■■□□□ 1.64
MRPS6-201ENST00000399312 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.26■■□□□ 1.63
MRPS6-201ENST00000399312 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.22■■□□□ 1.63
MRPS6-201ENST00000399312 PTPRMP28827 1452 aa25.21■■□□□ 1.63
MRPS6-201ENST00000399312 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.21■■□□□ 1.63
MRPS6-201ENST00000399312 PREX2Q70Z35 1606 aa25.19■■□□□ 1.62
MRPS6-201ENST00000399312 ATP10AO60312 1499 aa25.17■■□□□ 1.62
MRPS6-201ENST00000399312 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.17■■□□□ 1.62
MRPS6-201ENST00000399312 MADDQ8WXG6 1647 aa25.16■■□□□ 1.62
MRPS6-201ENST00000399312 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.16■■□□□ 1.62
MRPS6-201ENST00000399312 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.15■■□□□ 1.62
MRPS6-201ENST00000399312 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.13■■□□□ 1.61
MRPS6-201ENST00000399312 KDM5CP41229 1560 aa25.13■■□□□ 1.61
MRPS6-201ENST00000399312 CEP162Q5TB80 1403 aa25.11■■□□□ 1.61
MRPS6-201ENST00000399312 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
MRPS6-201ENST00000399312 ABCC1P33527 1531 aa25.09■■□□□ 1.61
MRPS6-201ENST00000399312 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.09■■□□□ 1.61
MRPS6-201ENST00000399312 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.08■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 AFAP1Q8N556 730 aa25.07■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.07■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.06■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.06■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.05■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 MLECQ14165 292 aa25.04■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 REREQ9P2R6 1566 aa25.04■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.03■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
MRPS6-201ENST00000399312 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
MRPS6-201ENST00000399312 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.99■■□□□ 1.59
MRPS6-201ENST00000399312 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.98■■□□□ 1.59
MRPS6-201ENST00000399312 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.98■■□□□ 1.59
MRPS6-201ENST00000399312 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.97■■□□□ 1.59
MRPS6-201ENST00000399312 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.95■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 ABCA6Q8N139 1617 aa24.94■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.94■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 AGLP35573 1532 aa24.94■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.94■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.93■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
MRPS6-201ENST00000399312 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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MRPS6-201ENST00000399312 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.88■■□□□ 1.57
MRPS6-201ENST00000399312 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.87■■□□□ 1.57
MRPS6-201ENST00000399312 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.579e-7■■■■□ 22.5
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MRPS6-201ENST00000399312 ATP7AQ04656 1500 aa24.86■■□□□ 1.57
MRPS6-201ENST00000399312 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.84■■□□□ 1.57
MRPS6-201ENST00000399312 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.84■■□□□ 1.57
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MRPS6-201ENST00000399312 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.8■■□□□ 1.56
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MRPS6-201ENST00000399312 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.78■■□□□ 1.56
MRPS6-201ENST00000399312 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.78■■□□□ 1.56
MRPS6-201ENST00000399312 A2MP01023 1474 aa24.77■■□□□ 1.56
MRPS6-201ENST00000399312 MAP3K1Q13233 1512 aa24.77■■□□□ 1.56
MRPS6-201ENST00000399312 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.77■■□□□ 1.56
MRPS6-201ENST00000399312 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.76■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.74■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 MROH2AA6NES4 1674 aa24.73■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.73■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.73■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 HSPA2P54652 639 aa24.73■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 C3P01024 1663 aa24.72■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 TSPY4P0CV99 314 aa24.71■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 TSPY10P0CW01 314 aa24.71■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 PLXNC1O60486 1568 aa24.71■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.7■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 MBD5Q9P267 1494 aa24.7■■□□□ 1.55
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
MRPS6-201ENST00000399312 NPATQ14207 1427 aa24.68■■□□□ 1.54
MRPS6-201ENST00000399312 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.65■■□□□ 1.54
MRPS6-201ENST00000399312 GGT6Q6P531 493 aa24.65■■□□□ 1.54
MRPS6-201ENST00000399312 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
MRPS6-201ENST00000399312 MIA2Q96PC5 1412 aa24.63■■□□□ 1.53
MRPS6-201ENST00000399312 FBXO41Q8TF61 875 aa24.63■■□□□ 1.53
MRPS6-201ENST00000399312 ZMYM3Q14202 1370 aa24.63■■□□□ 1.53
MRPS6-201ENST00000399312 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.62■■□□□ 1.53
MRPS6-201ENST00000399312 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
MRPS6-201ENST00000399312 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.59■■□□□ 1.53
MRPS6-201ENST00000399312 KIF3BO15066 747 aa24.55■■□□□ 1.52
MRPS6-201ENST00000399312 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.52■■□□□ 1.52
MRPS6-201ENST00000399312 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
MRPS6-201ENST00000399312 PTPRTO14522 1441 aa24.51■■□□□ 1.51
MRPS6-201ENST00000399312 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.51■■□□□ 1.51
MRPS6-201ENST00000399312 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.49■■□□□ 1.51
MRPS6-201ENST00000399312 PTPRKQ15262 1439 aa24.48■■□□□ 1.51
MRPS6-201ENST00000399312 STRCQ7RTU9 1775 aa24.47■■□□□ 1.51
MRPS6-201ENST00000399312 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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