RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396039.1

PARD6B-202, Transcript of par-6 family cell polarity regulator beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARD6B, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6B-202ENST00000396039 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
PARD6B-202ENST00000396039 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
PARD6B-202ENST00000396039 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.24■■■■□ 3.39
PARD6B-202ENST00000396039 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.22■■■■□ 3.39
PARD6B-202ENST00000396039 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.22■■■■□ 3.39
PARD6B-202ENST00000396039 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.18■■■■□ 3.38
PARD6B-202ENST00000396039 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
PARD6B-202ENST00000396039 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.18■■■■□ 3.38
PARD6B-202ENST00000396039 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
PARD6B-202ENST00000396039 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.14■■■■□ 3.38
PARD6B-202ENST00000396039 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.12■■■■□ 3.37
PARD6B-202ENST00000396039 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.12■■■■□ 3.37
PARD6B-202ENST00000396039 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.11■■■■□ 3.37
PARD6B-202ENST00000396039 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.11■■■■□ 3.37
PARD6B-202ENST00000396039 ATP10AO60312 1499 aa36.08■■■■□ 3.37
PARD6B-202ENST00000396039 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.08■■■■□ 3.37
PARD6B-202ENST00000396039 KDM5CP41229 1560 aa36.06■■■■□ 3.36
PARD6B-202ENST00000396039 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.05■■■■□ 3.36
PARD6B-202ENST00000396039 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.05■■■■□ 3.36
PARD6B-202ENST00000396039 PREX2Q70Z35 1606 aa36.05■■■■□ 3.36
PARD6B-202ENST00000396039 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.03■■■■□ 3.36
PARD6B-202ENST00000396039 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.98■■■■□ 3.35
PARD6B-202ENST00000396039 REREQ9P2R6 1566 aa35.93■■■■□ 3.34
PARD6B-202ENST00000396039 MLECQ14165 292 aa35.93■■■■□ 3.34
PARD6B-202ENST00000396039 ABCC1P33527 1531 aa35.92■■■■□ 3.34
PARD6B-202ENST00000396039 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.91■■■■□ 3.34
PARD6B-202ENST00000396039 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.91■■■■□ 3.34
PARD6B-202ENST00000396039 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.89■■■■□ 3.34
PARD6B-202ENST00000396039 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.89■■■■□ 3.34
PARD6B-202ENST00000396039 AFAP1Q8N556 730 aa35.87■■■■□ 3.33
PARD6B-202ENST00000396039 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.87■■■■□ 3.33
PARD6B-202ENST00000396039 ABCA6Q8N139 1617 aa35.83■■■■□ 3.33
PARD6B-202ENST00000396039 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.83■■■■□ 3.33
PARD6B-202ENST00000396039 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.82■■■■□ 3.32
PARD6B-202ENST00000396039 FBXO41Q8TF61 875 aa35.77■■■■□ 3.32
PARD6B-202ENST00000396039 AGLP35573 1532 aa35.77■■■■□ 3.32
PARD6B-202ENST00000396039 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.76■■■■□ 3.32
PARD6B-202ENST00000396039 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PARD6B-202ENST00000396039 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.74■■■■□ 3.31
PARD6B-202ENST00000396039 HSPA2P54652 639 aa35.71■■■■□ 3.31
PARD6B-202ENST00000396039 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.7■■■■□ 3.31
PARD6B-202ENST00000396039 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
PARD6B-202ENST00000396039 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.67■■■■□ 3.3
PARD6B-202ENST00000396039 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.66■■■■□ 3.3
PARD6B-202ENST00000396039 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PARD6B-202ENST00000396039 C3P01024 1663 aa35.63■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.63■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.62■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.61■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.61■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.6■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.57■■■■□ 3.29
PARD6B-202ENST00000396039 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
PARD6B-202ENST00000396039 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
PARD6B-202ENST00000396039 ATP7AQ04656 1500 aa35.55■■■■□ 3.28
PARD6B-202ENST00000396039 MROH2AA6NES4 1674 aa35.54■■■■□ 3.28
PARD6B-202ENST00000396039 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
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PARD6B-202ENST00000396039 CEP162Q5TB80 1403 aa35.49■■■■□ 3.27
PARD6B-202ENST00000396039 TIAM1Q13009 1591 aa35.48■■■■□ 3.27
PARD6B-202ENST00000396039 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.27
PARD6B-202ENST00000396039 STRCQ7RTU9 1775 aa35.46■■■■□ 3.27
PARD6B-202ENST00000396039 PLXNC1O60486 1568 aa35.46■■■■□ 3.27
PARD6B-202ENST00000396039 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.45■■■■□ 3.27
PARD6B-202ENST00000396039 A2MP01023 1474 aa35.41■■■■□ 3.26
PARD6B-202ENST00000396039 NPATQ14207 1427 aa35.4■■■■□ 3.26
PARD6B-202ENST00000396039 CERKQ8TCT0 537 aa35.38■■■■□ 3.25
PARD6B-202ENST00000396039 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
PARD6B-202ENST00000396039 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.32■■■■□ 3.24
PARD6B-202ENST00000396039 PTPRTO14522 1441 aa35.32■■■■□ 3.24
PARD6B-202ENST00000396039 MBD5Q9P267 1494 aa35.3■■■■□ 3.24
PARD6B-202ENST00000396039 ZMYM3Q14202 1370 aa35.3■■■■□ 3.24
PARD6B-202ENST00000396039 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.28■■■■□ 3.24
PARD6B-202ENST00000396039 NCOA2Q15596 1464 aa35.26■■■■□ 3.23
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PARD6B-202ENST00000396039 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
PARD6B-202ENST00000396039 NCOA1Q15788 1441 aa35.23■■■■□ 3.23
PARD6B-202ENST00000396039 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.22■■■■□ 3.23
PARD6B-202ENST00000396039 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.21■■■■□ 3.23
PARD6B-202ENST00000396039 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.21■■■■□ 3.23
PARD6B-202ENST00000396039 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.21■■■■□ 3.23
PARD6B-202ENST00000396039 GGT6Q6P531 493 aa35.19■■■■□ 3.22
PARD6B-202ENST00000396039 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.18■■■■□ 3.22
PARD6B-202ENST00000396039 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.17■■■■□ 3.22
PARD6B-202ENST00000396039 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.16■■■■□ 3.22
PARD6B-202ENST00000396039 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
PARD6B-202ENST00000396039 PTPRKQ15262 1439 aa35.15■■■■□ 3.22
PARD6B-202ENST00000396039 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.14■■■■□ 3.22
PARD6B-202ENST00000396039 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
PARD6B-202ENST00000396039 PLA2R1Q13018 1463 aa35.1■■■■□ 3.21
PARD6B-202ENST00000396039 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.09■■■■□ 3.21
PARD6B-202ENST00000396039 MAP3K1Q13233 1512 aa35.07■■■■□ 3.21
PARD6B-202ENST00000396039 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.07■■■■□ 3.2
PARD6B-202ENST00000396039 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.06■■■■□ 3.2
PARD6B-202ENST00000396039 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.04■■■■□ 3.2
PARD6B-202ENST00000396039 TSPY4P0CV99 314 aa35.02■■■■□ 3.2
PARD6B-202ENST00000396039 TSPY10P0CW01 314 aa35.02■■■■□ 3.2
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