RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374517.5

TXN-202, Transcript of thioredoxin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TXN, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXN-202ENST00000374517 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.5■■■■■ 4.71
TXN-202ENST00000374517 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.5■■■■■ 4.71
TXN-202ENST00000374517 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.49■■■■■ 4.71
TXN-202ENST00000374517 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
TXN-202ENST00000374517 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.42■■■■■ 4.7
TXN-202ENST00000374517 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.41■■■■■ 4.7
TXN-202ENST00000374517 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.41■■■■■ 4.7
TXN-202ENST00000374517 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.39■■■■■ 4.7
TXN-202ENST00000374517 PREX2Q70Z35 1606 aa44.38■■■■■ 4.69
TXN-202ENST00000374517 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.32■■■■■ 4.69
TXN-202ENST00000374517 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.31■■■■■ 4.68
TXN-202ENST00000374517 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.31■■■■■ 4.68
TXN-202ENST00000374517 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.3■■■■■ 4.68
TXN-202ENST00000374517 AFAP1Q8N556 730 aa44.3■■■■■ 4.68
TXN-202ENST00000374517 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.3■■■■■ 4.68
TXN-202ENST00000374517 ABCC1P33527 1531 aa44.22■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.21■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 KDM5CP41229 1560 aa44.2■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.2■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 MADDQ8WXG6 1647 aa44.2■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 PTPRMP28827 1452 aa44.2■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.19■■■■■ 4.67
TXN-202ENST00000374517 ATP10AO60312 1499 aa44.18■■■■■ 4.66
TXN-202ENST00000374517 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.17■■■■■ 4.66
TXN-202ENST00000374517 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.16■■■■■ 4.66
TXN-202ENST00000374517 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.13■■■■■ 4.66
TXN-202ENST00000374517 MLECQ14165 292 aa44.13■■■■■ 4.66
TXN-202ENST00000374517 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.13■■■■■ 4.65
TXN-202ENST00000374517 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.12■■■■■ 4.65
TXN-202ENST00000374517 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.12■■■■■ 4.65
TXN-202ENST00000374517 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
TXN-202ENST00000374517 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.09■■■■■ 4.65
TXN-202ENST00000374517 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.07■■■■■ 4.64
TXN-202ENST00000374517 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.64
TXN-202ENST00000374517 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.05■■■■■ 4.64
TXN-202ENST00000374517 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.03■■■■■ 4.64
TXN-202ENST00000374517 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.02■■■■■ 4.64
TXN-202ENST00000374517 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.01■■■■■ 4.64
TXN-202ENST00000374517 TIAM1Q13009 1591 aa43.99■■■■■ 4.63
TXN-202ENST00000374517 ABCA6Q8N139 1617 aa43.99■■■■■ 4.63
TXN-202ENST00000374517 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.96■■■■■ 4.63
TXN-202ENST00000374517 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.94■■■■■ 4.62
TXN-202ENST00000374517 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.92■■■■■ 4.62
TXN-202ENST00000374517 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.91■■■■■ 4.62
TXN-202ENST00000374517 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.9■■■■■ 4.62
TXN-202ENST00000374517 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
TXN-202ENST00000374517 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
TXN-202ENST00000374517 NCOA2Q15596 1464 aa43.88■■■■■ 4.61
TXN-202ENST00000374517 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
TXN-202ENST00000374517 REREQ9P2R6 1566 aa43.87■■■■■ 4.61
TXN-202ENST00000374517 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.8■■■■■ 4.6
TXN-202ENST00000374517 AGLP35573 1532 aa43.76■■■■■ 4.6
TXN-202ENST00000374517 ATP7AQ04656 1500 aa43.76■■■■■ 4.6
TXN-202ENST00000374517 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
TXN-202ENST00000374517 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
TXN-202ENST00000374517 MBD5Q9P267 1494 aa43.71■■■■■ 4.59
TXN-202ENST00000374517 MAP3K1Q13233 1512 aa43.71■■■■■ 4.59
TXN-202ENST00000374517 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.69■■■■■ 4.58
TXN-202ENST00000374517 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
TXN-202ENST00000374517 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.66■■■■■ 4.58
TXN-202ENST00000374517 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
TXN-202ENST00000374517 A2MP01023 1474 aa43.59■■■■■ 4.57
TXN-202ENST00000374517 APLP2Q06481 763 aa43.59■■■■■ 4.57
TXN-202ENST00000374517 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.55■■■■■ 4.56
TXN-202ENST00000374517 HSPA2P54652 639 aa43.54■■■■■ 4.56
TXN-202ENST00000374517 PLXNC1O60486 1568 aa43.54■■■■■ 4.56
TXN-202ENST00000374517 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.51■■■■■ 4.56
TXN-202ENST00000374517 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.49■■■■■ 4.55
TXN-202ENST00000374517 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.48■■■■■ 4.55
TXN-202ENST00000374517 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.46■■■■■ 4.55
TXN-202ENST00000374517 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.46■■■■■ 4.55
TXN-202ENST00000374517 C3P01024 1663 aa43.46■■■■■ 4.55
TXN-202ENST00000374517 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.43■■■■■ 4.54
TXN-202ENST00000374517 GGT6Q6P531 493 aa43.42■■■■■ 4.54
TXN-202ENST00000374517 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.41■■■■■ 4.54
TXN-202ENST00000374517 TSPY4P0CV99 314 aa43.38■■■■■ 4.53
TXN-202ENST00000374517 TSPY10P0CW01 314 aa43.38■■■■■ 4.53
TXN-202ENST00000374517 MIA2Q96PC5 1412 aa43.38■■■■■ 4.53
TXN-202ENST00000374517 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
TXN-202ENST00000374517 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
TXN-202ENST00000374517 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.32■■■■■ 4.53
TXN-202ENST00000374517 ZMYM3Q14202 1370 aa43.3■■■■■ 4.52
TXN-202ENST00000374517 MROH2AA6NES4 1674 aa43.3■■■■■ 4.52
TXN-202ENST00000374517 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
TXN-202ENST00000374517 KIF3BO15066 747 aa43.26■■■■■ 4.52
TXN-202ENST00000374517 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.22■■■■■ 4.51
TXN-202ENST00000374517 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.2■■■■■ 4.51
TXN-202ENST00000374517 NPATQ14207 1427 aa43.18■■■■■ 4.5
TXN-202ENST00000374517 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.18■■■■■ 4.5
TXN-202ENST00000374517 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
TXN-202ENST00000374517 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.14■■■■■ 4.5
TXN-202ENST00000374517 PTPRKQ15262 1439 aa43.09■■■■■ 4.49
TXN-202ENST00000374517 ABCC5O15440 1437 aa43.06■■■■■ 4.48
TXN-202ENST00000374517 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
TXN-202ENST00000374517 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.03■■■■■ 4.48
TXN-202ENST00000374517 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.03■■■■■ 4.48
TXN-202ENST00000374517 STRCQ7RTU9 1775 aa43.02■■■■■ 4.48
TXN-202ENST00000374517 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.01■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms