RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373709.7

SERINC2-201, Transcript of serine incorporator 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERINC2, Length 1,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2-201ENST00000373709 TSPOAP1O95153 1857 aa41.66■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.65■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.65■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 CD109Q6YHK3 1445 aa41.65■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.65■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.65■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SERINC2-201ENST00000373709 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.61■■■■■ 4.25
SERINC2-201ENST00000373709 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.58■■■■■ 4.25
SERINC2-201ENST00000373709 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
SERINC2-201ENST00000373709 PREX2Q70Z35 1606 aa41.57■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.54■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.54■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 PLCH2O75038 1416 aa41.54■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 ITGAEP38570 1179 aa41.54■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SERINC2-201ENST00000373709 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.5■■■■■ 4.23
SERINC2-201ENST00000373709 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
SERINC2-201ENST00000373709 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
SERINC2-201ENST00000373709 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
SERINC2-201ENST00000373709 FANCAO15360 1455 aa41.45■■■■■ 4.23
SERINC2-201ENST00000373709 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.44■■■■■ 4.22
SERINC2-201ENST00000373709 NEUROD1Q13562 356 aa41.38■■■■■ 4.21
SERINC2-201ENST00000373709 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.38■■■■■ 4.21
SERINC2-201ENST00000373709 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.35■■■■■ 4.21
SERINC2-201ENST00000373709 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.35■■■■■ 4.21
SERINC2-201ENST00000373709 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.35■■■■■ 4.21
SERINC2-201ENST00000373709 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.33■■■■■ 4.21
SERINC2-201ENST00000373709 MIA2Q96PC5 1412 aa41.32■■■■■ 4.2
SERINC2-201ENST00000373709 AKNAQ7Z591 1439 aa41.29■■■■■ 4.2
SERINC2-201ENST00000373709 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.27■■■■■ 4.2
SERINC2-201ENST00000373709 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.26■■■■■ 4.2
SERINC2-201ENST00000373709 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.26■■■■■ 4.2
SERINC2-201ENST00000373709 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 ADGRL1O94910 1474 aa41.25■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 MIER1Q8N108 512 aa41.24■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 ABCC1P33527 1531 aa41.23■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.22■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 NEO1Q92859 1461 aa41.22■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.21■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
SERINC2-201ENST00000373709 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.18■■■■■ 4.18
SERINC2-201ENST00000373709 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
SERINC2-201ENST00000373709 HFM1A2PYH4 1435 aa41.14■■■■■ 4.18
SERINC2-201ENST00000373709 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.14■■■■■ 4.18
SERINC2-201ENST00000373709 RAPGEF3O95398 923 aa41.14■■■■■ 4.18
SERINC2-201ENST00000373709 MBD5Q9P267 1494 aa41.12■■■■■ 4.17
SERINC2-201ENST00000373709 AFAP1Q8N556 730 aa41.1■■■■■ 4.17
SERINC2-201ENST00000373709 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.06■■■■■ 4.16
SERINC2-201ENST00000373709 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.06■■■■■ 4.16
SERINC2-201ENST00000373709 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
SERINC2-201ENST00000373709 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.02■■■■■ 4.16
SERINC2-201ENST00000373709 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.02■■■■■ 4.16
SERINC2-201ENST00000373709 ABCC5O15440 1437 aa41.01■■■■■ 4.16
SERINC2-201ENST00000373709 DAPK1P53355 1430 aa41■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 PTPRKQ15262 1439 aa41■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.99■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 RICTORQ6R327 1708 aa40.99■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.99■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.98■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 KDM6BO15054 1643 aa40.98■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.97■■■■■ 4.15
SERINC2-201ENST00000373709 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.94■■■■■ 4.14
SERINC2-201ENST00000373709 NAIPQ13075 1403 aa40.93■■■■■ 4.14
SERINC2-201ENST00000373709 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.92■■■■■ 4.14
SERINC2-201ENST00000373709 KDM5CP41229 1560 aa40.88■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.86■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.86■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.85■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.84■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 TSPY4P0CV99 314 aa40.83■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 TSPY10P0CW01 314 aa40.83■■■■■ 4.13
SERINC2-201ENST00000373709 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.82■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.79■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.78■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.78■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.77■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 ATP7AQ04656 1500 aa40.77■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.76■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
SERINC2-201ENST00000373709 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.75■■■■■ 4.11
SERINC2-201ENST00000373709 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.74■■■■■ 4.11
SERINC2-201ENST00000373709 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
SERINC2-201ENST00000373709 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.72■■■■■ 4.11
SERINC2-201ENST00000373709 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.71■■■■■ 4.11
SERINC2-201ENST00000373709 ABCA6Q8N139 1617 aa40.69■■■■■ 4.1
SERINC2-201ENST00000373709 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.68■■■■■ 4.1
SERINC2-201ENST00000373709 NCOA1Q15788 1441 aa40.66■■■■■ 4.1
SERINC2-201ENST00000373709 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.64■■■■■ 4.1
SERINC2-201ENST00000373709 ADGRL2O95490 1459 aa40.63■■■■■ 4.09
SERINC2-201ENST00000373709 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.63■■■■■ 4.09
SERINC2-201ENST00000373709 TONSLQ96HA7 1378 aa40.62■■■■■ 4.09
SERINC2-201ENST00000373709 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.62■■■■■ 4.09
SERINC2-201ENST00000373709 KIF15Q9NS87 1388 aa40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms