RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368298.2

LMNA-204, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMNA, Length 1,475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNA-204ENST00000368298 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
LMNA-204ENST00000368298 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.31■■■□□ 2.28
LMNA-204ENST00000368298 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
LMNA-204ENST00000368298 AKNAQ7Z591 1439 aa29.3■■■□□ 2.28
LMNA-204ENST00000368298 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.28■■■□□ 2.28
LMNA-204ENST00000368298 NCOA2Q15596 1464 aa29.28■■■□□ 2.28
LMNA-204ENST00000368298 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.27■■■□□ 2.28
LMNA-204ENST00000368298 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.2■■■□□ 2.27
LMNA-204ENST00000368298 ADGRL1O94910 1474 aa29.2■■■□□ 2.27
LMNA-204ENST00000368298 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
LMNA-204ENST00000368298 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
LMNA-204ENST00000368298 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.17■■■□□ 2.26
LMNA-204ENST00000368298 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.15■■■□□ 2.26
LMNA-204ENST00000368298 RICTORQ6R327 1708 aa29.15■■■□□ 2.26
LMNA-204ENST00000368298 RAPGEF3O95398 923 aa29.14■■■□□ 2.26
LMNA-204ENST00000368298 ABCC1P33527 1531 aa29.12■■■□□ 2.25
LMNA-204ENST00000368298 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.12■■■□□ 2.25
LMNA-204ENST00000368298 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.1■■■□□ 2.25
LMNA-204ENST00000368298 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.1■■■□□ 2.25
LMNA-204ENST00000368298 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.09■■■□□ 2.25
LMNA-204ENST00000368298 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.09■■■□□ 2.25
LMNA-204ENST00000368298 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.08■■■□□ 2.25
LMNA-204ENST00000368298 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.07■■■□□ 2.24
LMNA-204ENST00000368298 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
LMNA-204ENST00000368298 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.06■■■□□ 2.24
LMNA-204ENST00000368298 MIA2Q96PC5 1412 aa29.06■■■□□ 2.24
LMNA-204ENST00000368298 KDM5CP41229 1560 aa29.03■■■□□ 2.24
LMNA-204ENST00000368298 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
LMNA-204ENST00000368298 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.01■■■□□ 2.24
LMNA-204ENST00000368298 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.01■■■□□ 2.23
LMNA-204ENST00000368298 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.01■■■□□ 2.23
LMNA-204ENST00000368298 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LMNA-204ENST00000368298 AFAP1Q8N556 730 aa28.99■■■□□ 2.23
LMNA-204ENST00000368298 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.98■■■□□ 2.23
LMNA-204ENST00000368298 MBD5Q9P267 1494 aa28.98■■■□□ 2.23
LMNA-204ENST00000368298 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
LMNA-204ENST00000368298 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.95■■■□□ 2.22
LMNA-204ENST00000368298 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.93■■■□□ 2.22
LMNA-204ENST00000368298 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.92■■■□□ 2.22
LMNA-204ENST00000368298 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.92■■■□□ 2.22
LMNA-204ENST00000368298 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.92■■■□□ 2.22
LMNA-204ENST00000368298 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.91■■■□□ 2.22
LMNA-204ENST00000368298 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.89■■■□□ 2.22
LMNA-204ENST00000368298 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.89■■■□□ 2.21
LMNA-204ENST00000368298 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
LMNA-204ENST00000368298 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.88■■■□□ 2.21
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LMNA-204ENST00000368298 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.86■■■□□ 2.21
LMNA-204ENST00000368298 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
LMNA-204ENST00000368298 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.85■■■□□ 2.21
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LMNA-204ENST00000368298 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
LMNA-204ENST00000368298 ATP10AO60312 1499 aa28.82■■■□□ 2.2
LMNA-204ENST00000368298 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.82■■■□□ 2.2
LMNA-204ENST00000368298 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.8■■■□□ 2.2
LMNA-204ENST00000368298 ATP7AQ04656 1500 aa28.8■■■□□ 2.2
LMNA-204ENST00000368298 ABCA6Q8N139 1617 aa28.78■■■□□ 2.2
LMNA-204ENST00000368298 REREQ9P2R6 1566 aa28.77■■■□□ 2.2
LMNA-204ENST00000368298 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.77■■■□□ 2.2
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LMNA-204ENST00000368298 TSPY10P0CW01 314 aa28.74■■■□□ 2.19
LMNA-204ENST00000368298 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.74■■■□□ 2.19
LMNA-204ENST00000368298 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
LMNA-204ENST00000368298 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.72■■■□□ 2.19
LMNA-204ENST00000368298 ABCC5O15440 1437 aa28.72■■■□□ 2.19
LMNA-204ENST00000368298 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
LMNA-204ENST00000368298 DAPK1P53355 1430 aa28.7■■■□□ 2.19
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LMNA-204ENST00000368298 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.69■■■□□ 2.18
LMNA-204ENST00000368298 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
LMNA-204ENST00000368298 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
LMNA-204ENST00000368298 AGLP35573 1532 aa28.67■■■□□ 2.18
LMNA-204ENST00000368298 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.67■■■□□ 2.18
LMNA-204ENST00000368298 A2MP01023 1474 aa28.64■■■□□ 2.18
LMNA-204ENST00000368298 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
LMNA-204ENST00000368298 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.64■■■□□ 2.17
LMNA-204ENST00000368298 PLXNC1O60486 1568 aa28.63■■■□□ 2.17
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LMNA-204ENST00000368298 NCOA1Q15788 1441 aa28.52■■■□□ 2.16
LMNA-204ENST00000368298 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.52■■■□□ 2.16
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LMNA-204ENST00000368298 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.49■■■□□ 2.15
LMNA-204ENST00000368298 KIF15Q9NS87 1388 aa28.49■■■□□ 2.15
LMNA-204ENST00000368298 MADDQ8WXG6 1647 aa28.47■■■□□ 2.15
LMNA-204ENST00000368298 MLECQ14165 292 aa28.46■■■□□ 2.15
LMNA-204ENST00000368298 ROCK1Q13464 1354 aa28.46■■■□□ 2.15
LMNA-204ENST00000368298 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.46■■■□□ 2.15
LMNA-204ENST00000368298 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
LMNA-204ENST00000368298 ERBINQ96RT1 1412 aa28.43■■■□□ 2.14
LMNA-204ENST00000368298 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.43■■■□□ 2.14
LMNA-204ENST00000368298 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.43■■■□□ 2.14
LMNA-204ENST00000368298 KIF3BO15066 747 aa28.41■■■□□ 2.14
LMNA-204ENST00000368298 PTPRMP28827 1452 aa28.39■■■□□ 2.13
LMNA-204ENST00000368298 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
LMNA-204ENST00000368298 ITGAEP38570 1179 aa28.38■■■□□ 2.13
LMNA-204ENST00000368298 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
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