RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP249-201ENST00000365490 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP249-201ENST00000365490 CD109Q6YHK3 1445 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP249-201ENST00000365490 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.91□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 FANCAO15360 1455 aa14.91□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.91□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP249-201ENST00000365490 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 NEO1Q92859 1461 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 MBD5Q9P267 1494 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 ABCC1P33527 1531 aa14.87□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 AKNAQ7Z591 1439 aa14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 TSPOAP1O95153 1857 aa14.84□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 ABCC5O15440 1437 aa14.83□□□□□ -0.03
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 ADGRL1O94910 1474 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 DAPK1P53355 1430 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 PTPRKQ15262 1439 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.81□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.79□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.78□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.78□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.77□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.77□□□□□ -0.04
RN7SKP249-201ENST00000365490 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 ROCK1Q13464 1354 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 TSPY4P0CV99 314 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 TSPY10P0CW01 314 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 ITGAEP38570 1179 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 AFAP1Q8N556 730 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 ADGRL2O95490 1459 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 RICTORQ6R327 1708 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 KDM5CP41229 1560 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 NCOA1Q15788 1441 aa14.74□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAPGEF3O95398 923 aa14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.71□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.71□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 HFM1A2PYH4 1435 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 PLXNC1O60486 1568 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 NAIPQ13075 1403 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATP7AQ04656 1500 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 HRCP23327 699 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 KIF15Q9NS87 1388 aa14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 KDM6BO15054 1643 aa14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ABCA6Q8N139 1617 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ERBINQ96RT1 1412 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATP10AO60312 1499 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 A2MP01023 1474 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 REREQ9P2R6 1566 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.57□□□□□ -0.08
RN7SKP249-201ENST00000365490 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RN7SKP249-201ENST00000365490 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.56□□□□□ -0.08
RN7SKP249-201ENST00000365490 AGLP35573 1532 aa14.54□□□□□ -0.08
RN7SKP249-201ENST00000365490 DEPDC5O75140 1603 aa14.52□□□□□ -0.08
RN7SKP249-201ENST00000365490 UNC13BO14795 1591 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms