RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362802.1

RNU4-21P-201, Transcript of RNA, U4 small nuclear 21, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU4-21P, Length 126 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU4-21P-201ENST00000362802 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RNU4-21P-201ENST00000362802 SNPHO15079 494 aa10.62□□□□□ -0.71
RNU4-21P-201ENST00000362802 C2orf72A6NCS6 295 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU4-21P-201ENST00000362802 KIF3CO14782 793 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU4-21P-201ENST00000362802 DOK7Q18PE1 504 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU4-21P-201ENST00000362802 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
RNU4-21P-201ENST00000362802 ST18O60284 1047 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 PDE4AP27815 886 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 RIMBP2O15034 1052 aa10.5□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 DSG2Q14126 1118 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 PLPP6Q8IY26 295 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 FOXK1P85037 733 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU4-21P-201ENST00000362802 PLCB2Q00722 1185 aa10.45□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.45□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 MARVELD3Q96A59 401 aa10.43□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.42□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 POTEMA6NI47 508 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 POTEGQ6S5H5 508 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 EMP3P54852 163 aa10.4□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 ARSIQ5FYB1 569 aa10.4□□□□□ -0.74
RNU4-21P-201ENST00000362802 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 MFSD10Q14728 455 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 SLC34A2O95436 690 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 GPR153Q6NV75 609 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 WDR70Q9NW82 654 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 TBC1D12O60347 775 aa10.35□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 FAM205CA6NFA0 338 aa10.34□□□□□ -0.75
RNU4-21P-201ENST00000362802 ERBB3P21860 1342 aa10.33□□□□□ -0.76
RNU4-21P-201ENST00000362802 NUDT7P0C024 238 aa10.33□□□□□ -0.76
RNU4-21P-201ENST00000362802 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RNU4-21P-201ENST00000362802 OXER1Q8TDS5 423 aa10.3□□□□□ -0.76
RNU4-21P-201ENST00000362802 MAP3K9P80192 1104 aa10.28□□□□□ -0.76
RNU4-21P-201ENST00000362802 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RNU4-21P-201ENST00000362802 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.28□□□□□ -0.76
RNU4-21P-201ENST00000362802 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.27□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 E2F4Q16254 413 aa10.26□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 CAMK2BQ13554 666 aa10.25□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.24□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 LHX6Q9UPM6 363 aa10.24□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 DPYSL4O14531 572 aa10.23□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 POTEB3A0JP26 581 aa10.22□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 EVI5O60447 810 aa10.22□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 POTEBQ6S5H4 581 aa10.22□□□□□ -0.77
RNU4-21P-201ENST00000362802 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU4-21P-201ENST00000362802 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU4-21P-201ENST00000362802 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RNU4-21P-201ENST00000362802 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU4-21P-201ENST00000362802 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.13□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 P3H3Q8IVL6 736 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 PDIA6Q15084 440 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 JPH4Q96JJ6 628 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 FOSBP53539 338 aa10.09□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 DDX12PQ92771 950 aa10.09□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.09□□□□□ -0.79
RNU4-21P-201ENST00000362802 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 KCNH8Q96L42 1107 aa10.07□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 PBX2P40425 430 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 PHF14O94880 888 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 KCNK17Q96T54 332 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 ARHGAP33O14559 1287 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 TYW1BQ6NUM6 668 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 PSEN2P49810 448 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 NBR1Q14596 966 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU4-21P-201ENST00000362802 PTPREP23469 700 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 PTGER2P43116 358 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 FBXW7Q969H0 707 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 EPAS1Q99814 870 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.02□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
RNU4-21P-201ENST00000362802 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97 ms