RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360476.7

NMB-201, Transcript of neuromedin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-201ENST00000360476 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.71■■■■■ 4.75
NMB-201ENST00000360476 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.67■■■■■ 4.74
NMB-201ENST00000360476 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
NMB-201ENST00000360476 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.66■■■■■ 4.74
NMB-201ENST00000360476 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
NMB-201ENST00000360476 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.57■■■■■ 4.73
NMB-201ENST00000360476 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.55■■■■■ 4.72
NMB-201ENST00000360476 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.54■■■■■ 4.72
NMB-201ENST00000360476 CLIP1P30622 1438 aa44.53■■■■■ 4.72
NMB-201ENST00000360476 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.52■■■■■ 4.72
NMB-201ENST00000360476 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
NMB-201ENST00000360476 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.5■■■■■ 4.71
NMB-201ENST00000360476 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.49■■■■■ 4.71
NMB-201ENST00000360476 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.47■■■■■ 4.71
NMB-201ENST00000360476 PREX2Q70Z35 1606 aa44.46■■■■■ 4.71
NMB-201ENST00000360476 KDM5CP41229 1560 aa44.41■■■■■ 4.7
NMB-201ENST00000360476 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.4■■■■■ 4.7
NMB-201ENST00000360476 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.39■■■■■ 4.7
NMB-201ENST00000360476 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.39■■■■■ 4.7
NMB-201ENST00000360476 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.38■■■■■ 4.69
NMB-201ENST00000360476 ATP10AO60312 1499 aa44.37■■■■■ 4.69
NMB-201ENST00000360476 MLECQ14165 292 aa44.36■■■■■ 4.69
NMB-201ENST00000360476 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.35■■■■■ 4.69
NMB-201ENST00000360476 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.32■■■■■ 4.69
NMB-201ENST00000360476 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.32■■■■■ 4.69
NMB-201ENST00000360476 ABCC1P33527 1531 aa44.31■■■■■ 4.68
NMB-201ENST00000360476 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.29■■■■■ 4.68
NMB-201ENST00000360476 AFAP1Q8N556 730 aa44.29■■■■■ 4.68
NMB-201ENST00000360476 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.29■■■■■ 4.68
NMB-201ENST00000360476 ABCA6Q8N139 1617 aa44.28■■■■■ 4.68
NMB-201ENST00000360476 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.21■■■■■ 4.67
NMB-201ENST00000360476 REREQ9P2R6 1566 aa44.14■■■■■ 4.66
NMB-201ENST00000360476 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.13■■■■■ 4.66
NMB-201ENST00000360476 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.13■■■■■ 4.65
NMB-201ENST00000360476 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.13■■■■■ 4.65
NMB-201ENST00000360476 HSPA2P54652 639 aa44.11■■■■■ 4.65
NMB-201ENST00000360476 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.11■■■■■ 4.65
NMB-201ENST00000360476 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.05■■■■■ 4.64
NMB-201ENST00000360476 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.04■■■■■ 4.64
NMB-201ENST00000360476 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
NMB-201ENST00000360476 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
NMB-201ENST00000360476 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
NMB-201ENST00000360476 AGLP35573 1532 aa43.96■■■■■ 4.63
NMB-201ENST00000360476 C3P01024 1663 aa43.95■■■■■ 4.63
NMB-201ENST00000360476 CEP162Q5TB80 1403 aa43.9■■■■■ 4.62
NMB-201ENST00000360476 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
NMB-201ENST00000360476 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.88■■■■■ 4.61
NMB-201ENST00000360476 TIAM1Q13009 1591 aa43.87■■■■■ 4.61
NMB-201ENST00000360476 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
NMB-201ENST00000360476 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.84■■■■■ 4.61
NMB-201ENST00000360476 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
NMB-201ENST00000360476 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
NMB-201ENST00000360476 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.83■■■■■ 4.61
NMB-201ENST00000360476 ATP7AQ04656 1500 aa43.81■■■■■ 4.6
NMB-201ENST00000360476 FBXO41Q8TF61 875 aa43.8■■■■■ 4.6
NMB-201ENST00000360476 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
NMB-201ENST00000360476 STRCQ7RTU9 1775 aa43.78■■■■■ 4.6
NMB-201ENST00000360476 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.77■■■■■ 4.6
NMB-201ENST00000360476 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
NMB-201ENST00000360476 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
NMB-201ENST00000360476 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.73■■■■■ 4.59
NMB-201ENST00000360476 PLXNC1O60486 1568 aa43.71■■■■■ 4.59
NMB-201ENST00000360476 MROH2AA6NES4 1674 aa43.68■■■■■ 4.58
NMB-201ENST00000360476 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
NMB-201ENST00000360476 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
NMB-201ENST00000360476 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
NMB-201ENST00000360476 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.63■■■■■ 4.57
NMB-201ENST00000360476 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.62■■■■■ 4.57
NMB-201ENST00000360476 A2MP01023 1474 aa43.62■■■■■ 4.57
NMB-201ENST00000360476 MBD5Q9P267 1494 aa43.58■■■■■ 4.57
NMB-201ENST00000360476 NCOA2Q15596 1464 aa43.54■■■■■ 4.56
NMB-201ENST00000360476 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.48■■■■■ 4.55
NMB-201ENST00000360476 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.46■■■■■ 4.55
NMB-201ENST00000360476 ZMYM3Q14202 1370 aa43.45■■■■■ 4.55
NMB-201ENST00000360476 CERKQ8TCT0 537 aa43.45■■■■■ 4.55
NMB-201ENST00000360476 NPATQ14207 1427 aa43.43■■■■■ 4.54
NMB-201ENST00000360476 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.41■■■■■ 4.54
NMB-201ENST00000360476 MYO3AQ8NEV4 1616 aa43.4■■■■■ 4.54
NMB-201ENST00000360476 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.38■■■■■ 4.54
NMB-201ENST00000360476 GGT6Q6P531 493 aa43.38■■■■■ 4.53
NMB-201ENST00000360476 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.38■■■■■ 4.53
NMB-201ENST00000360476 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
NMB-201ENST00000360476 NCOA1Q15788 1441 aa43.35■■■■■ 4.53
NMB-201ENST00000360476 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.34■■■■■ 4.53
NMB-201ENST00000360476 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.33■■■■■ 4.53
NMB-201ENST00000360476 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.32■■■■■ 4.53
NMB-201ENST00000360476 PTPRTO14522 1441 aa43.31■■■■■ 4.52
NMB-201ENST00000360476 PTPRKQ15262 1439 aa43.31■■■■■ 4.52
NMB-201ENST00000360476 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.29■■■■■ 4.52
NMB-201ENST00000360476 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
NMB-201ENST00000360476 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
NMB-201ENST00000360476 LTBP4Q8N2S1 1624 aa43.18■■■■■ 4.5
NMB-201ENST00000360476 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
NMB-201ENST00000360476 MAP3K1Q13233 1512 aa43.15■■■■■ 4.5
NMB-201ENST00000360476 KIF3BO15066 747 aa43.14■■■■■ 4.5
NMB-201ENST00000360476 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.14■■■■■ 4.5
NMB-201ENST00000360476 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.12■■■■■ 4.49
NMB-201ENST00000360476 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.1■■■■■ 4.49
NMB-201ENST00000360476 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.09■■■■■ 4.49
NMB-201ENST00000360476 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.09■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms