RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.15■■■■■ 4.18
PPP4R4-202ENST00000328839 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.14■■■■■ 4.18
PPP4R4-202ENST00000328839 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.11■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.1■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.1■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.07■■■■■ 4.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
PPP4R4-202ENST00000328839 CLIP1P30622 1438 aa41.06■■■■■ 4.16
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.02■■■■■ 4.16
PPP4R4-202ENST00000328839 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 MLECQ14165 292 aa40.98■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.96■■■■■ 4.15
PPP4R4-202ENST00000328839 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.93■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.91■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP10AO60312 1499 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.89■■■■■ 4.14
PPP4R4-202ENST00000328839 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.85■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 PREX2Q70Z35 1606 aa40.83■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 KDM5CP41229 1560 aa40.82■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 AFAP1Q8N556 730 aa40.82■■■■■ 4.13
PPP4R4-202ENST00000328839 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4R4-202ENST00000328839 HSPA2P54652 639 aa40.74■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.73■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC1P33527 1531 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCA6Q8N139 1617 aa40.68■■■■■ 4.1
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.65■■■■■ 4.1
PPP4R4-202ENST00000328839 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.63■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO41Q8TF61 875 aa40.61■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 REREQ9P2R6 1566 aa40.61■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.59■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
PPP4R4-202ENST00000328839 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.54■■■■■ 4.08
PPP4R4-202ENST00000328839 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.52■■■■■ 4.08
PPP4R4-202ENST00000328839 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.48■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 AGLP35573 1532 aa40.47■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
PPP4R4-202ENST00000328839 C3P01024 1663 aa40.43■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.41■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.39■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.39■■■■■ 4.06
PPP4R4-202ENST00000328839 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.32■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP7AQ04656 1500 aa40.3■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 STRCQ7RTU9 1775 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP162Q5TB80 1403 aa40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
PPP4R4-202ENST00000328839 TIAM1Q13009 1591 aa40.24■■■■■ 4.03
PPP4R4-202ENST00000328839 CERKQ8TCT0 537 aa40.22■■■■■ 4.03
PPP4R4-202ENST00000328839 MROH2AA6NES4 1674 aa40.19■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.18■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 A2MP01023 1474 aa40.16■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 PLXNC1O60486 1568 aa40.15■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.12■■■■■ 4.01
PPP4R4-202ENST00000328839 ZMYM3Q14202 1370 aa40.08■■■■■ 4.01
PPP4R4-202ENST00000328839 GGT6Q6P531 493 aa40.05■■■■■ 4
PPP4R4-202ENST00000328839 NPATQ14207 1427 aa40.05■■■■■ 4
PPP4R4-202ENST00000328839 MBD5Q9P267 1494 aa40.03■■■■■ 4
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOA2Q15596 1464 aa40■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRTO14522 1441 aa39.99■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOA1Q15788 1441 aa39.96■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.95■■■■□ 3.99
PPP4R4-202ENST00000328839 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.91■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRKQ15262 1439 aa39.88■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.83■■■■□ 3.97
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF3BO15066 747 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.76■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 PLA2R1Q13018 1463 aa39.72■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 TSPY4P0CV99 314 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4R4-202ENST00000328839 TSPY10P0CW01 314 aa39.7■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms