RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 PLCH2O75038 1416 aa29.76■■■□□ 2.35
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CCDC71-201ENST00000321895 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.44■■■□□ 2.3
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CCDC71-201ENST00000321895 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.42■■■□□ 2.3
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CCDC71-201ENST00000321895 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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CCDC71-201ENST00000321895 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CCDC71-201ENST00000321895 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CCDC71-201ENST00000321895 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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CCDC71-201ENST00000321895 A2MP01023 1474 aa28.97■■■□□ 2.23
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CCDC71-201ENST00000321895 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.92■■■□□ 2.22
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