RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.54■■■□□ 2
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TNNT1-201ENST00000291901 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.48■■□□□ 1.99
TNNT1-201ENST00000291901 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.47■■□□□ 1.99
TNNT1-201ENST00000291901 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
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TNNT1-201ENST00000291901 MLECQ14165 292 aa27.45■■□□□ 1.98
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TNNT1-201ENST00000291901 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.36■■□□□ 1.97
TNNT1-201ENST00000291901 ATP10AO60312 1499 aa27.36■■□□□ 1.97
TNNT1-201ENST00000291901 AFAP1Q8N556 730 aa27.35■■□□□ 1.97
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.33■■□□□ 1.97
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TNNT1-201ENST00000291901 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.32■■□□□ 1.96
TNNT1-201ENST00000291901 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.32■■□□□ 1.96
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TNNT1-201ENST00000291901 KDM5CP41229 1560 aa27.29■■□□□ 1.96
TNNT1-201ENST00000291901 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.27■■□□□ 1.96
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TNNT1-201ENST00000291901 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.24■■□□□ 1.95
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TNNT1-201ENST00000291901 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.16■■□□□ 1.94
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TNNT1-201ENST00000291901 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.14■■□□□ 1.93
TNNT1-201ENST00000291901 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.14■■□□□ 1.93
TNNT1-201ENST00000291901 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.12■■□□□ 1.93
TNNT1-201ENST00000291901 REREQ9P2R6 1566 aa27.12■■□□□ 1.93
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TNNT1-201ENST00000291901 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.08■■□□□ 1.93
TNNT1-201ENST00000291901 C3P01024 1663 aa27.07■■□□□ 1.92
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TNNT1-201ENST00000291901 AGLP35573 1532 aa27.05■■□□□ 1.92
TNNT1-201ENST00000291901 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TNNT1-201ENST00000291901 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.02■■□□□ 1.92
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TNNT1-201ENST00000291901 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TNNT1-201ENST00000291901 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
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TNNT1-201ENST00000291901 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.99■■□□□ 1.91
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TNNT1-201ENST00000291901 ZMYM3Q14202 1370 aa26.83■■□□□ 1.88
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TNNT1-201ENST00000291901 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.77■■□□□ 1.88
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TNNT1-201ENST00000291901 NCOA1Q15788 1441 aa26.71■■□□□ 1.87
TNNT1-201ENST00000291901 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.7■■□□□ 1.86
TNNT1-201ENST00000291901 PTPRKQ15262 1439 aa26.68■■□□□ 1.86
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.68■■□□□ 1.86
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TNNT1-201ENST00000291901 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.65■■□□□ 1.86
TNNT1-201ENST00000291901 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TNNT1-201ENST00000291901 KIF3BO15066 747 aa26.63■■□□□ 1.85
TNNT1-201ENST00000291901 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.62■■□□□ 1.85
TNNT1-201ENST00000291901 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.62■■□□□ 1.85
TNNT1-201ENST00000291901 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.61■■□□□ 1.85
TNNT1-201ENST00000291901 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.59■■□□□ 1.85
TNNT1-201ENST00000291901 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.58■■□□□ 1.85
TNNT1-201ENST00000291901 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TNNT1-201ENST00000291901 TSPY4P0CV99 314 aa26.55■■□□□ 1.84
TNNT1-201ENST00000291901 TSPY10P0CW01 314 aa26.55■■□□□ 1.84
TNNT1-201ENST00000291901 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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