RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 RAPGEF3O95398 923 aa26.62■■□□□ 1.85
SRSF1-201ENST00000258962 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.62■■□□□ 1.85
SRSF1-201ENST00000258962 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SRSF1-201ENST00000258962 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.59■■□□□ 1.85
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.58■■□□□ 1.85
SRSF1-201ENST00000258962 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SRSF1-201ENST00000258962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF1-201ENST00000258962 ADGRL1O94910 1474 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF1-201ENST00000258962 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF1-201ENST00000258962 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SRSF1-201ENST00000258962 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SRSF1-201ENST00000258962 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SRSF1-201ENST00000258962 PREX2Q70Z35 1606 aa26.49■■□□□ 1.83
SRSF1-201ENST00000258962 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.48■■□□□ 1.83
SRSF1-201ENST00000258962 NCOA2Q15596 1464 aa26.47■■□□□ 1.83
SRSF1-201ENST00000258962 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.46■■□□□ 1.83
SRSF1-201ENST00000258962 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.43■■□□□ 1.82
SRSF1-201ENST00000258962 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.43■■□□□ 1.82
SRSF1-201ENST00000258962 RICTORQ6R327 1708 aa26.42■■□□□ 1.82
SRSF1-201ENST00000258962 AFAP1Q8N556 730 aa26.39■■□□□ 1.82
SRSF1-201ENST00000258962 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.39■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.38■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 HRCP23327 699 aa26.38■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.36■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.35■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 ABCC1P33527 1531 aa26.35■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.35■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.35■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.35■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.34■■□□□ 1.81
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.32■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.32■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.32■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.31■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.31■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.29■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.28■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.28■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 KDM5CP41229 1560 aa26.27■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.27■■□□□ 1.8
SRSF1-201ENST00000258962 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SRSF1-201ENST00000258962 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SRSF1-201ENST00000258962 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.23■■□□□ 1.79
SRSF1-201ENST00000258962 ATP10AO60312 1499 aa26.23■■□□□ 1.79
SRSF1-201ENST00000258962 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.21■■□□□ 1.79
SRSF1-201ENST00000258962 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SRSF1-201ENST00000258962 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.21■■□□□ 1.79
SRSF1-201ENST00000258962 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.19■■□□□ 1.78
SRSF1-201ENST00000258962 MIA2Q96PC5 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
SRSF1-201ENST00000258962 ITGAEP38570 1179 aa26.18■■□□□ 1.78
SRSF1-201ENST00000258962 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.17■■□□□ 1.78
SRSF1-201ENST00000258962 MBD5Q9P267 1494 aa26.17■■□□□ 1.78
SRSF1-201ENST00000258962 TSPY4P0CV99 314 aa26.13■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 TSPY10P0CW01 314 aa26.13■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.11■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.11■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 MLECQ14165 292 aa26.11■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.11■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 ATP7AQ04656 1500 aa26.09■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 ABCA6Q8N139 1617 aa26.08■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 PTPRKQ15262 1439 aa26.08■■□□□ 1.77
SRSF1-201ENST00000258962 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.07■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.07■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.05■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 REREQ9P2R6 1566 aa26.04■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.03■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.02■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SRSF1-201ENST00000258962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SRSF1-201ENST00000258962 SETD5Q9C0A6 1442 aa26■■□□□ 1.75
SRSF1-201ENST00000258962 A2MP01023 1474 aa26■■□□□ 1.75
SRSF1-201ENST00000258962 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.99■■□□□ 1.75
SRSF1-201ENST00000258962 AGLP35573 1532 aa25.99■■□□□ 1.75
SRSF1-201ENST00000258962 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SRSF1-201ENST00000258962 MADDQ8WXG6 1647 aa25.96■■□□□ 1.75
SRSF1-201ENST00000258962 PTPRMP28827 1452 aa25.95■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 DAPK1P53355 1430 aa25.94■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.93■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.93■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 HFM1A2PYH4 1435 aa25.93■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.93■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 ABCC5O15440 1437 aa25.92■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.91■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.89■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 GGT6Q6P531 493 aa25.89■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 NAIPQ13075 1403 aa25.89■■□□□ 1.74
SRSF1-201ENST00000258962 PLXNC1O60486 1568 aa25.88■■□□□ 1.73
SRSF1-201ENST00000258962 KIF3BO15066 747 aa25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms