RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 GPR37O15354 613 aa10.65□□□□□ -0.7
MDM2-201ENST00000258148 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.65□□□□□ -0.7
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MDM2-201ENST00000258148 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
MDM2-201ENST00000258148 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
MDM2-201ENST00000258148 IFNL1Q8IU54 200 aa10.63□□□□□ -0.71
MDM2-201ENST00000258148 PITPNM1O00562 1244 aa10.61□□□□□ -0.71
MDM2-201ENST00000258148 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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MDM2-201ENST00000258148 NECTIN2Q92692 538 aa10.6□□□□□ -0.71
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MDM2-201ENST00000258148 DSG2Q14126 1118 aa10.38□□□□□ -0.75
MDM2-201ENST00000258148 MS4A1P11836 297 aa10.36□□□□□ -0.75
MDM2-201ENST00000258148 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
MDM2-201ENST00000258148 NUTM2FA1L443 756 aa10.35□□□□□ -0.75
MDM2-201ENST00000258148 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
MDM2-201ENST00000258148 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
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MDM2-201ENST00000258148 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.34□□□□□ -0.75
MDM2-201ENST00000258148 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
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MDM2-201ENST00000258148 HIC1Q14526 733 aa10.32□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 OXER1Q8TDS5 423 aa10.32□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.31□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.31□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
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MDM2-201ENST00000258148 POM121Q96HA1 1249 aa10.3□□□□□ -0.76
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.29□□□□□ -0.76
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MDM2-201ENST00000258148 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.28□□□□□ -0.76
MDM2-201ENST00000258148 RGS22Q8NE09 1264 aa10.26□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.26□□□□□ -0.77
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MDM2-201ENST00000258148 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 TRPC6Q9Y210 931 aa10.25□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 RAD21O60216 631 aa10.24□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.23□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 PTGER2P43116 358 aa10.22□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 PTGDRQ13258 359 aa10.22□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.22□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 PLPP6Q8IY26 295 aa10.22□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 RETREG2Q8NC44 543 aa10.22□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 PHF12Q96QT6 1004 aa10.22□□□□□ -0.77
MDM2-201ENST00000258148 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
MDM2-201ENST00000258148 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.781e-7■□□□□ 9.6
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MDM2-201ENST00000258148 TMC2Q8TDI7 906 aa10.19□□□□□ -0.78
MDM2-201ENST00000258148 IRF5Q13568 498 aa10.18□□□□□ -0.78
MDM2-201ENST00000258148 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.786e-12■■□□□ 11.5
MDM2-201ENST00000258148 COG6Q9Y2V7 657 aa10.18□□□□□ -0.78
MDM2-201ENST00000258148 KIF3CO14782 793 aa10.17□□□□□ -0.78
MDM2-201ENST00000258148 MAP3K9P80192 1104 aa10.17□□□□□ -0.78
MDM2-201ENST00000258148 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
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MDM2-201ENST00000258148 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
MDM2-201ENST00000258148 CLCN1P35523 988 aa10.14□□□□□ -0.79
MDM2-201ENST00000258148 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.14□□□□□ -0.79
MDM2-201ENST00000258148 C2orf72A6NCS6 295 aa10.14□□□□□ -0.79
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MDM2-201ENST00000258148 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
MDM2-201ENST00000258148 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.13□□□□□ -0.79
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