RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219551.2

RHBDL1-201, Transcript of rhomboid like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDL1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1-201ENST00000219551 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.28■■■□□ 2.28
RHBDL1-201ENST00000219551 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
RHBDL1-201ENST00000219551 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.25■■■□□ 2.27
RHBDL1-201ENST00000219551 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.24■■■□□ 2.27
RHBDL1-201ENST00000219551 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
RHBDL1-201ENST00000219551 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 FANCAO15360 1455 aa29.19■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.19■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 TSPOAP1O95153 1857 aa29.19■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.15■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.14■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.14■■■□□ 2.26
RHBDL1-201ENST00000219551 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.14■■■□□ 2.25
RHBDL1-201ENST00000219551 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
RHBDL1-201ENST00000219551 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.251e-6■□□□□ 8.8
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RHBDL1-201ENST00000219551 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.1■■■□□ 2.25
RHBDL1-201ENST00000219551 AKNAQ7Z591 1439 aa29.1■■■□□ 2.25
RHBDL1-201ENST00000219551 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
RHBDL1-201ENST00000219551 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.07■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 ABCC1P33527 1531 aa29.06■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 ADGRL1O94910 1474 aa29.05■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.02■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 MBD5Q9P267 1494 aa29.02■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.02■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.01■■■□□ 2.24
RHBDL1-201ENST00000219551 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.01■■■□□ 2.23
RHBDL1-201ENST00000219551 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.99■■■□□ 2.23
RHBDL1-201ENST00000219551 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RHBDL1-201ENST00000219551 ABCC5O15440 1437 aa28.94■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 DAPK1P53355 1430 aa28.94■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.94■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.94■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 ITGAEP38570 1179 aa28.93■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 TSPY4P0CV99 314 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 TSPY10P0CW01 314 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 AFAP1Q8N556 730 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDL1-201ENST00000219551 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.88■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 PTPRKQ15262 1439 aa28.88■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 RAPGEF3O95398 923 aa28.87■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 RICTORQ6R327 1708 aa28.86■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.86■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 KDM5CP41229 1560 aa28.83■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.83■■■□□ 2.21
RHBDL1-201ENST00000219551 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
RHBDL1-201ENST00000219551 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.82■■■□□ 2.2
RHBDL1-201ENST00000219551 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.81■■■□□ 2.2
RHBDL1-201ENST00000219551 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.81■■■□□ 2.2
RHBDL1-201ENST00000219551 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.8■■■□□ 2.2
RHBDL1-201ENST00000219551 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.79■■■□□ 2.2
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RHBDL1-201ENST00000219551 ROCK1Q13464 1354 aa28.76■■■□□ 2.2
RHBDL1-201ENST00000219551 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.76■■■□□ 2.2
RHBDL1-201ENST00000219551 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.75■■■□□ 2.19
RHBDL1-201ENST00000219551 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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RHBDL1-201ENST00000219551 NCOA1Q15788 1441 aa28.74■■■□□ 2.19
RHBDL1-201ENST00000219551 ATP7AQ04656 1500 aa28.74■■■□□ 2.19
RHBDL1-201ENST00000219551 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.74■■■□□ 2.19
RHBDL1-201ENST00000219551 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.74■■■□□ 2.19
RHBDL1-201ENST00000219551 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.73■■■□□ 2.19
RHBDL1-201ENST00000219551 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.72■■■□□ 2.19
RHBDL1-201ENST00000219551 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.71■■■□□ 2.19
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RHBDL1-201ENST00000219551 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.6■■■□□ 2.17
RHBDL1-201ENST00000219551 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.6■■■□□ 2.17
RHBDL1-201ENST00000219551 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.59■■■□□ 2.17
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RHBDL1-201ENST00000219551 ERBINQ96RT1 1412 aa28.52■■■□□ 2.16
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RHBDL1-201ENST00000219551 HRCP23327 699 aa28.49■■■□□ 2.15
RHBDL1-201ENST00000219551 REREQ9P2R6 1566 aa28.49■■■□□ 2.15
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RHBDL1-201ENST00000219551 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
RHBDL1-201ENST00000219551 KIF3BO15066 747 aa28.41■■■□□ 2.14
RHBDL1-201ENST00000219551 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.4■■■□□ 2.14
RHBDL1-201ENST00000219551 AGLP35573 1532 aa28.4■■■□□ 2.14
RHBDL1-201ENST00000219551 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.36■■■□□ 2.13
RHBDL1-201ENST00000219551 DEPDC5O75140 1603 aa28.33■■■□□ 2.13
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