RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	WHAMM	Q8TF30	809 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	BSND	Q8WZ55	320 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	AOX1	Q06278	1338 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	HTT	P42858	3142 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CEP290	O15078	2479 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658		F8W031	263 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658		M0R082	166 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	PLIN1	O60240	522 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CSF1R	P07333	972 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ITPKA	P23677	461 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF76	P36508	570 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNJ4	P48050	445 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CERS5	Q8N5B7	392 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	TTC9	Q92623	222 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	COA1	Q9GZY4	146 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	LILRB5	O75023	590 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CDC25B	P30305	580 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	FOXO4	P98177	505 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	FANCC	Q00597	558 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	KANK3	Q6NY19	840 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	LINS1	Q8NG48	757 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	RNF34	Q969K3	372 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ADAM19	Q9H013	955 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF576	Q9H609	170 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CD209	Q9NNX6	404 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	LAMB1	P07942	1786 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CLRN2	A0PK11	232 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CDC27	P30260	824 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	SOX13	Q9UN79	622 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
MFSD8-240	ENST00000641658	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	IL16	Q14005	1332 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	FKBP1B	P68106	108 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	MAP3K10	Q02779	954 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	GRIK5	Q16478	980 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	BEND3	Q5T5X7	828 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	EPHA1	P21709	976 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	NF2	P35240	595 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	DLGAP5	Q15398	846 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	CFAP100	Q494V2	611 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	SVOP	Q8N4V2	548 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	BRCA2	P51587	3418 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	GYG1	P46976	350 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	TM4SF4	P48230	202 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	PCDH1	Q08174	1060 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	FAAP100	Q0VG06	881 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MFSD8-240	ENST00000641658	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.94	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms