RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616761.1

TTLL9-209, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 9, human

TSL 5

Gene TTLL9, Length 1,808 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL9-209	ENST00000616761	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	PDILT	Q8N807	584 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	MMP1	P03956	469 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	PLCG2	P16885	1265 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	FECH	P22830	423 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	DHX58	Q96C10	678 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TROAP	Q12815	778 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	LAMB1	P07942	1786 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	BRCA2	P51587	3418 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	XBP1	P17861	261 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	EVX2	Q03828	476 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	KIF5C	O60282	957 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TUBB	P07437	444 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CAPN2	P17655	700 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	PBX1	P40424	430 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	FUT2	Q10981	343 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ERLIN1	O75477	346 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	NFIA	Q12857	509 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	MED15	Q96RN5	788 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TTLL9-209	ENST00000616761	MYH6	P13533	1939 aa		13.02	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms