RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TEC	P42680	631 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CDK17	Q00537	523 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	SV2B	Q7L1I2	683 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CEP95	Q96GE4	821 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RAB34	Q9BZG1	259 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	STK4	Q13043	487 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CERK	Q8TCT0	537 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		20.57	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ADRA2B	P18089	450 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1328	Q86T90	577 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf37	Q96NL8	207 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PIGS	Q96S52	555 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	GAK	O14976	1311 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RHBDL3	P58872	404 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PNKP	Q96T60	521 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CPVL	Q9H3G5	476 aa		20.56	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	MCM3	P25205	808 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	HERVK_113	P62684	666 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CALCRL	Q16602	461 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CRY2	Q49AN0	593 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR9	Q96QG7	549 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		20.55	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PDIA5	Q14554	519 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CENPP	Q6IPU0	288 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	L1RE1	Q9UN81	338 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ABCB11	O95342	1321 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	BBOX1	O75936	387 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	WDR93	Q6P2C0	686 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	UNC13D	Q70J99	1090 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		20.54	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	LY75	O60449	1722 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L5	A8MUK1	530 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PDHB	P11177	359 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	FCER1A	P12319	257 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TXK	P42681	527 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY7	P51828	1080 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ST5	P78524	1137 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	MIIP	Q5JXC2	388 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	POTED	Q86YR6	584 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ANO9	A1A5B4	782 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TOM1	O60784	492 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		20.53	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		20.52	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		20.52	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	20.52	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	20.52	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	20.52	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		20.52	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	ABCB6	Q9NP58	842 aa		20.52	■□□□□ 0.88
RRN3-205	ENST00000563559	RASSF10	A6NK89	507 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	VSNL1	P62760	191 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC63	Q05C16	580 aa		20.51	■□□□□ 0.87

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