RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.95■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC15Q8TF66 581 aa23.95■■□□□ 1.42
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.92■■□□□ 1.42
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GH2P01242 217 aa23.91■■□□□ 1.42
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DLGAP5Q15398 846 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MFAP3LO75121 409 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BMP3P12645 472 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCNE1P24864 410 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAF1Q13077 416 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.91■■□□□ 1.42
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OGFOD1Q8N543 542 aa23.91■■□□□ 1.42
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 P2RX5Q93086 422 aa23.91■■□□□ 1.42
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