RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957		E9PSI1	815 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SORBS3	O60504	671 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ATE1	O95260	518 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTM1	P09488	218 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TACR1	P25103	407 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	THBS2	P35442	1172 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	FHL2	Q14192	279 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	SELENOP	P49908	381 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR42	O15529	346 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	ACR	P10323	421 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2C8	P10632	490 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	ERCC3	P19447	782 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PWP1	Q13610	501 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	CABP7	Q86V35	215 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	MUSK	O15146	869 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALT3	O60512	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	GREM1	O60565	184 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	C8B	P07358	591 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	L1CAM	P32004	1257 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	KY	Q8NBH2	561 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-223	ENST00000560957	SHOX	O15266	292 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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