RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PRKG1Q13976 671 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 MASTLQ96GX5 879 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 STAP2Q9UGK3 403 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 AKT3Q9Y243 479 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 TNKSO95271 1327 aa7.01□□□□□ -1.29
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PDE4D-226ENST00000546160 PRDM1O75626 825 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 COPB2P35606 906 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PTK2Q05397 1052 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 POLA2Q14181 598 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PALM2Q8IXS6 379 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CBX8Q9HC52 389 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 WDR70Q9NW82 654 aa7.01□□□□□ -1.29
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PDE4D-226ENST00000546160 CMA1P23946 247 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2J2P51589 502 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PSMD2Q13200 908 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 HHATQ5VTY9 493 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 RRAGAQ7L523 313 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SKAP1Q86WV1 359 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 GREM2Q9H772 168 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SATB1Q01826 763 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SLC7A3Q8WY07 619 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CIITAP33076 1130 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 MFAP3P55082 362 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 ACCSQ96QU6 501 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC68Q9H2F9 335 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 DIP2AQ14689 1571 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 BMP3P12645 472 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 HOXD10P28358 340 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 ADD2P35612 726 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SCNN1DP51172 638 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 MYO1EQ12965 1108 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CEP85LQ5SZL2 805 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 TTLL6Q8N841 843 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CCHCR1Q8TD31 782 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 RPS6KA2Q15349 733 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7□□□□□ -1.29
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PDE4D-226ENST00000546160 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7□□□□□ -1.29
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PDE4D-226ENST00000546160 SNX25Q9H3E2 840 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CHD4Q14839 1912 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC160A6NGH7 325 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 ME3Q16798 604 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SYDE2Q5VT97 1194 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 HVCN1Q96D96 273 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 HAUS8Q9BT25 410 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 HOMER3Q9NSC5 361 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINA10Q9UK55 444 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 MYL7Q01449 175 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 NLRP10Q86W26 655 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CDKL2Q92772 493 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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PDE4D-226ENST00000546160 NEDD9Q14511 834 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDE4D-226ENST00000546160 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PSAPP07602 524 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 PTGDRQ13258 359 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 GRAPQ13588 217 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 DCAF4Q8WV16 495 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 ST7Q9NRC1 585 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 OGFRQ9NZT2 677 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.99□□□□□ -1.29
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