RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L15	C9J2P7	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L11	C9JVI0	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L18	D6R9N7	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L22	D6RA61	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L19	D6RCP7	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L20	D6RJB6	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	FGR	P09769	529 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	ATP2B2	Q01814	1243 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	PTS	Q03393	145 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	PTH1R	Q03431	593 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	ICA1	Q05084	483 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP17L24	Q0WX57	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	ALX1	Q15699	326 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	CCL14	Q16627	93 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	REPS2	Q8NFH8	660 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	RNF217	Q8TC41	542 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	USP6NL	Q92738	828 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	SHISA4	Q96DD7	197 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	FEZ1	Q99689	392 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	NAPB	Q9H115	298 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	VCPKMT	Q9H867	229 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	CABP5	Q9NP86	173 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-234	ENST00000546048	NEDD4	P46934	1319 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	MYPN	Q86TC9	1320 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	PTPRF	P10586	1907 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	MYH1	P12882	1939 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048		F5H6K3	240 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	NDUFB10	O96000	172 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	IGHA2	P01877	340 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	GNAT2	P19087	354 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	CHML	P26374	656 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	NOV	P48745	357 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	FCGRT	P55899	365 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	SNAP25	P60880	206 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	ERVK-9	P63128	1117 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	ERVK-24	P63145	666 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	TFAP4	Q01664	338 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	KLRC3	Q07444	240 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	LBX2	Q6XYB7	198 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC17	Q96LX7	622 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	STK17A	Q9UEE5	414 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	RIPK3	Q9Y572	518 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	ADCY3	O60266	1144 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	COBL	O75128	1261 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	INHA	P05111	366 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	CYP2B6	P20813	491 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	GRK4	P32298	578 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	USP14	P54578	494 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	COG2	Q14746	738 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	GPR142	Q7Z601	462 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	TRPV1	Q8NER1	839 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	TRIB2	Q92519	343 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	MKL1	Q969V6	931 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	NYAP2	Q9P242	653 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	VWA5A	O00534	786 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	ORC4	O43929	436 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	RAD21	O60216	631 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	FLOT1	O75955	427 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	CCL5	P13501	91 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	ERCC3	P19447	782 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	MCC	P23508	829 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	PTGIR	P43119	386 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	SCTR	P47872	440 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	IRF5	Q13568	498 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	KIF22	Q14807	665 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-234	ENST00000546048	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		6	□□□□□ -1.45

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