RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	BAD	Q92934	168 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	EYS	Q5T1H1	3165 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	RAD50	Q92878	1312 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	GBF1	Q92538	1859 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LMO3-222	ENST00000540445	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	ZEB2	O60315	1214 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	RAG1	P15918	1043 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SMPD1	P17405	629 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CDK7	P50613	346 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	PDE4D	Q08499	809 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	FAAP100	Q0VG06	881 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SHH	Q15465	462 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TLK2	Q86UE8	772 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	DEFB123	Q8N688	67 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TOX2	Q96NM4	488 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	ELP1	O95163	1332 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.52	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SGSM2	O43147	1006 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CYP21A2	P08686	494 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CHST3	Q7LGC8	479 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	FBXO11	Q86XK2	927 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	KLRF2	D3W0D1	207 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445		E7EWF7	191 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	ARVCF	O00192	962 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	PTGS1	P23219	599 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	EPHB4	P54760	987 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	WTAP	Q15007	396 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SEC23A	Q15436	765 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TBC1D5	Q92609	795 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445		Q9Y3F1	56 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	ABCB11	O95342	1321 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CFB	P00751	764 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	GUCD1	Q96NT3	240 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	AMN	Q9BXJ7	453 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SCN5A	Q14524	2016 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	MYO9B	Q13459	2157 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CDH23	Q9H251	3354 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CABYR	O75952	493 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TIMP1	P01033	207 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CD4	P01730	458 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	MYL3	P08590	195 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	FPGS	Q05932	587 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	CASC1	Q6TDU7	716 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LMO3-222	ENST00000540445	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.48	□□□□□ -0.73

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