RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 USP38Q8NB14 1042 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 MORC4Q8TE76 937 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 IL23AQ9NPF7 189 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 GBF1Q92538 1859 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 CPVLQ9H3G5 476 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 Q9Y3F1 56 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF543Q08ER8 600 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 PPM1EQ8WY54 764 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 NEDD4P46934 1319 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 FGBP02675 491 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 MYL3P08590 195 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 SCLYQ96I15 445 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 VCANP13611 3396 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 HERVK_113Q902F9 699 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 COPS5Q92905 334 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 UBA5Q9GZZ9 404 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 PRDM6Q9NQX0 595 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMYM6O95789 1325 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP2C9P11712 490 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 SDSP20132 328 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 USH1GQ495M9 461 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 PDE4DQ08499 809 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 TTC14Q96N46 770 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 MSRAQ9UJ68 235 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 SCN5AQ14524 2016 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHDP01880 384 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 SNHG28P0DPA3 235 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 RABGGTBP53611 331 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 PURAQ00577 322 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 VWCEQ96DN2 955 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF213O14771 459 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D5Q92609 795 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 ESR2Q92731 530 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 TNKSO95271 1327 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBBXA8MT70 800 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 CHMP4BP1P59074 171 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 SMC5Q8IY18 1101 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 KDM4AO75164 1064 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 MYOGP15173 224 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 CPT1AP50416 773 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRE1Q14246 886 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP2R5BQ15173 497 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB30Q15771 203 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR19Q8NEZ3 1342 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 LAMA4Q16363 1823 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 ARIH2O95376 493 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 IGFBP4P22692 258 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 TICAM2Q86XR7 235 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 B4E1Z4 1266 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PTPRJ-205ENST00000527952 EDNRBP24530 442 aa28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms