RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 WDR18Q9BV38 432 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 PP2D1A8MPX8 630 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 PIK3CDO00329 1044 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 SMC2O95347 1197 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 AFMP43652 599 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 CCDC174Q6PII3 467 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.27■■□□□ 1.8
ACER3-204ENST00000525861 USP14P54578 494 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 KLRG1Q96E93 195 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 PICK1Q9NRD5 415 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 TECP42680 631 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 TXKP42681 527 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 MTMR2Q13614 643 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.26■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 PTPRAP18433 802 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 STAT6P42226 847 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.25■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 DPYDQ12882 1025 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 MORC3Q14149 939 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 FZD1Q9UP38 647 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 BMP6P22004 513 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 CYP3A7P24462 503 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SPP2Q13103 211 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 CABP7Q86V35 215 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 VCAM1P19320 739 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SREBF1P36956 1147 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 ARHGAP4P98171 946 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 HS1BP3Q53T59 392 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 MBOAT7Q96N66 472 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 RAB34Q9BZG1 259 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 ABCB11O95342 1321 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 BACE1P56817 501 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 DGKZQ13574 1117 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 LDHDQ86WU2 507 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 GSDMAQ96QA5 445 aa26.23■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 PDIA5Q14554 519 aa26.22■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SARM1Q6SZW1 724 aa26.22■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 HAS1Q92839 578 aa26.22■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 MTRQ99707 1265 aa26.22■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 IKBKBO14920 756 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 ICAM1P05362 532 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 MLKLQ8NB16 471 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 CUEDC2Q9H467 287 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 SMTNL1A8MU46 457 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.21■■□□□ 1.79
ACER3-204ENST00000525861 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 CFBP00751 764 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 POLR2MP0CAP2 368 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 CASP1P29466 404 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 STAMQ92783 540 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 DACH1Q9UI36 760 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 ZNF536O15090 1300 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.2■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 NCAPHQ15003 741 aa26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 ILDR2Q71H61 639 aa26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 SULF1Q8IWU6 871 aa26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 TRIM5Q9C035 493 aa26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.19■■□□□ 1.78
ACER3-204ENST00000525861 FLOT1O75955 427 aa26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms