RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	MYH6	P13533	1939 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	ELP1	O95163	1332 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TNKS	O95271	1327 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	LCT	P09848	1927 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FLOT1	O75955	427 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	CLTB	P09497	229 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	KRT85	P78386	507 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TLE2	Q04725	743 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ICA1	Q05084	483 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PLS1	Q14651	629 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131		A0A1W2PQY0	241 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	AKR1B1	P15121	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FOSL2	P15408	326 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	IFNAR1	P17181	557 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	RTN1	Q16799	776 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SLC25A27	O95847	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PGK1	P00558	417 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PGK2	P07205	417 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	RARB	P10826	455 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FCER1A	P12319	257 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	REST	Q13127	1097 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	UBE2H	P62256	183 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	NTRK3	Q16288	839 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	AKR1A1	P14550	325 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	DNAJB2	P25686	324 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FPGS	Q05932	587 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-223	ENST00000524131	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms