RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CAPNS2Q96L46 248 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 PTPN18Q99952 460 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 WDR18Q9BV38 432 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 USP26Q9BXU7 913 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 NAPBQ9H115 298 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ELP3Q9H9T3 547 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 SWAP70Q9UH65 585 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 PCNTO95613 3336 aa6.42□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 A0A1W2PRG0 241 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 SLC27A2O14975 620 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 F11P03951 625 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 APPP05067 770 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 SKIP12755 728 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ANTXR2P58335 489 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 PPATQ06203 517 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 SEPT2Q15019 361 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 OPTNQ96CV9 577 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CCDC17Q96LX7 622 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 GINM1Q9NU53 330 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 USP17L5A8MUK1 530 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 NMT2O60551 498 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 IL2RAP01589 272 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ASNSP08243 561 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 BCRP11274 1271 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 HSPA4P34932 840 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 TM4SF4P48230 202 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CENPCQ03188 943 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 DGKZQ13574 1117 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ACER1Q8TDN7 264 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ACDQ96AP0 544 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 CSADQ9Y600 493 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.4□□□□□ -1.38
MSRA-208ENST00000522907 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.4□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 E7EWF7 191 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 CXCL11O14625 94 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 MX2P20592 715 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 MAP2K2P36507 400 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 ECE1P42892 770 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 BACE1P56817 501 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 NOGQ13253 232 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 SEC23AQ15436 765 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 ANKS1AQ92625 1134 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 GLMNQ92990 594 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 MKL1Q969V6 931 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 CEP95Q96GE4 821 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 C12orf42Q96LP6 360 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 UCN2Q96RP3 112 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 KIF2CQ99661 725 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 NYAP2Q9P242 653 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 TMX2Q9Y320 296 aa6.39□□□□□ -1.39
MSRA-208ENST00000522907 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms