RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521189.1

CLVS1-207, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-207ENST00000521189 CLTAP09496 248 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SFTPCP11686 197 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PTPN2P17706 415 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 HALP42357 657 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CASP2P42575 452 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 BNIP1Q12981 228 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MAP2K5Q13163 448 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MTMR3Q13615 1198 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NFE2L1Q14494 772 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 IL23RQ5VWK5 629 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FAM228AQ86W67 206 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TRIM50Q86XT4 487 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MED30Q96HR3 178 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FGD4Q96M96 766 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SAMD11Q96NU1 681 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NLRP3Q96P20 1036 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 C12orf10Q9HB07 376 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 BTBD19C9JJ37 291 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KMOO15229 486 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 APOEP02649 317 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RUNX1T1Q06455 604 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MAPRE2Q15555 327 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM87BQ96K49 555 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CCDC42Q96M95 316 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.58□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 YKT6O15498 198 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SUPT3HO75486 399 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 LCA5LO95447 670 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 BAG3O95817 575 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 POTEJP0CG39 1038 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GHRP10912 638 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NFKBIAP25963 317 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 EPS15P42566 896 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CENPAP49450 140 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF75DP51815 510 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 UBE4AQ14139 1066 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 INSCQ1MX18 579 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 C8orf74Q6P047 294 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 USP38Q8NB14 1042 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 A0A1B0GVG6 124 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 BTBD11A6QL63 1104 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 E7ENQ6 273 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GNPATO15228 680 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 B4GALT4O60513 344 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PLCG2P16885 1265 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PRKAR1BP31321 381 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 THOP1P52888 689 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 E2F2Q14209 437 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PPP1R7Q15435 360 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 WASHC4Q2M389 1173 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SARM1Q6SZW1 724 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms