RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
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SH3BP2-208ENST00000504294 AK2P54819 239 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS6P62753 249 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
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SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC82Q8N4S0 544 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 WASF1Q92558 559 aa16.77■□□□□ 0.28
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SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.75■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.75■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SEPT4O43236 478 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 DEXIO95424 95 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SGPL1O95470 568 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 AKR1A1P14550 325 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 GNA11P29992 359 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 ARMCX2Q7L311 632 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 RMDN3Q96TC7 470 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 VTA1Q9NP79 307 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 STAM2O75886 525 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 STXBP2Q15833 593 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 RARBP10826 455 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ADCY7P51828 1080 aa16.72■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 MTFR1Q15390 333 aa16.72■□□□□ 0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNT17Q6IS24 598 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB118Q96PH6 123 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ESYT2A0FGR8 921 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.279e-7■■□□□ 12.4
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
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