RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496101.5

GCOM1-211, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,032 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-211ENST00000496101 H3BQF6 201 aa20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 VSNL1P62760 191 aa20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.35■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 RASSF10A6NK89 507 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 BTDP43251 543 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 VPS72Q15906 364 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 MIIPQ5JXC2 388 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 KIAA1328Q86T90 577 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 STK4Q13043 487 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 CENPPQ6IPU0 288 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.34■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 IL1R1P14778 569 aa20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 USP14P54578 494 aa20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 TEX11Q8IYF3 940 aa20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GCOM1-211ENST00000496101 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.33■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 ST5P78524 1137 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 SLF2Q8IX21 1173 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 TBCKQ8TEA7 893 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 MTMR9Q96QG7 549 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 ATP2B4P23634 1241 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 NFIXQ14938 502 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 SV2BQ7L1I2 683 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 GAKO14976 1311 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 TECP42680 631 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 CASP8Q14790 479 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 UNC13DQ70J99 1090 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 CD209Q9NNX6 404 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 MTMR7Q9Y216 660 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 VAV2P52735 878 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 MCM6Q14566 821 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 CEP95Q96GE4 821 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 FCER1AP12319 257 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 RHBDL3P58872 404 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 GRB10Q13322 594 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 MAP9Q49MG5 647 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 CNBD1Q8NA66 436 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 FAM71BQ8TC56 605 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 PIGSQ96S52 555 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 RAB34Q9BZG1 259 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 GPSM2P81274 684 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 PDIA5Q14554 519 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 POTEDQ86YR6 584 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 CPVLQ9H3G5 476 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 MED4Q9NPJ6 270 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 RFC4P35249 363 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-211ENST00000496101 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms