RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 NOVP48745 357 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 MORC4Q8TE76 937 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 MYL3P08590 195 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 CYP2C9P11712 490 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 VWCEQ96DN2 955 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 ZBBXA8MT70 800 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 TNFRSF10AO00220 468 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 ORC4O43929 436 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 CALML3P27482 149 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 SCN5AQ14524 2016 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 FGAP02671 866 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 FGRP09769 529 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 EVI5LQ96CN4 794 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 FAM227BQ96M60 508 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-217ENST00000489650 THEGQ9P2T0 379 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRN-217ENST00000489650 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 TTLL4Q14679 1199 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 ALX1Q15699 326 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 ASB2Q96Q27 587 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 TNKSO95271 1327 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 COPS5Q92905 334 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRN-217ENST00000489650 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRN-217ENST00000489650 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 PDHBP11177 359 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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PTPRN-217ENST00000489650 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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PTPRN-217ENST00000489650 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 CERS4Q9HA82 394 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 CHMP4BP1P59074 171 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTPRN-217ENST00000489650 CPVLQ9H3G5 476 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-217ENST00000489650 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.7■■□□□ 1.06
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PTPRN-217ENST00000489650 ZNF543Q08ER8 600 aa21.7■■□□□ 1.06
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PTPRN-217ENST00000489650 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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PTPRN-217ENST00000489650 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.7■■□□□ 1.06
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PTPRN-217ENST00000489650 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRN-217ENST00000489650 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN-217ENST00000489650 ARIH2O95376 493 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRN-217ENST00000489650 PFKMP08237 780 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRN-217ENST00000489650 EDNRBP24530 442 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRN-217ENST00000489650 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.68■■□□□ 1.06
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